47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2095 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  100 
 
 
510 aa  1011    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  29.93 
 
 
507 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  25.11 
 
 
497 aa  111  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  25.11 
 
 
497 aa  108  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  23.65 
 
 
597 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  24.1 
 
 
537 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  25.68 
 
 
610 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  25.17 
 
 
535 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3555  hypothetical protein  23.92 
 
 
592 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0913023  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  31.07 
 
 
508 aa  63.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
493 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3054  glycosyltransferase  24.6 
 
 
644 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  26.94 
 
 
513 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
509 aa  57  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
553 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  25.3 
 
 
499 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  29.51 
 
 
505 aa  55.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.22 
 
 
478 aa  54.7  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.22 
 
 
477 aa  54.7  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  24.88 
 
 
583 aa  53.5  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  28.96 
 
 
505 aa  53.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  27.22 
 
 
506 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  25.34 
 
 
513 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  23.24 
 
 
513 aa  52.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  23.94 
 
 
502 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  28.89 
 
 
495 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2397  glycosyltransferase  24.86 
 
 
641 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  26.14 
 
 
495 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
526 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  23.77 
 
 
812 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  26.09 
 
 
499 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
503 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  27.55 
 
 
582 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  25.53 
 
 
481 aa  48.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.67 
 
 
864 aa  48.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  23.5 
 
 
512 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  35.8 
 
 
493 aa  47.4  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  23.32 
 
 
541 aa  47  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  21.4 
 
 
487 aa  47  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.81 
 
 
496 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 
636 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.56 
 
 
505 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  26.09 
 
 
496 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  19.7 
 
 
506 aa  45.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  25.54 
 
 
497 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  25.77 
 
 
480 aa  43.9  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  25.13 
 
 
534 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>