70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4056 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4018  CheW protein  100 
 
 		 178 aa  360  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4056  CheW protein  100 
 
 		 178 aa  360  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  30.23 
 
 		 191 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  30.77 
 
 		 182 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  31.58 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  26.44 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  26.44 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  29.14 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  26.32 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  26.58 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0716  CheW protein  24.38 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  29.03 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  26.21 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  26.36 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  28 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  27.34 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  23.84 
 
 		 169 aa  47.8  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  22.88 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  26.67 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  24.86 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  27.2 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  24.39 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  26.27 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  25.16 
 
 		 161 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  25.77 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  26.32 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  23.77 
 
 		 444 aa  45.1  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  24.62 
 
 		 146 aa  45.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  26.99 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  25.95 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  25.88 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  25.43 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  27.4 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0149  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.25 
 
 		 175 aa  44.7  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  28 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  24.53 
 
 		 160 aa  44.3  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  23.73 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  25 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  27.41 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  26.79 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  23.93 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  22.5 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  29.75 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  24.53 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  23.39 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  26.55 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  31.82 
 
 		 344 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3257  CheW protein  22.4 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447869 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  22.45 
 
 		 319 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  31.91 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  27.66 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  24.62 
 
 		 324 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  23.88 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  28.71 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  29.29 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  23.73 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  27.27 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  24.64 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  26.27 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.4 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  27.27 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  25.95 
 
 		 779 aa  41.2  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  31.88 
 
 		 325 aa  41.2  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  24.58 
 
 		 161 aa  41.6  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  21.6 
 
 		 205 aa  41.2  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  28.35 
 
 		 168 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  37.88 
 
 		 159 aa  41.2  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  23.44 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  24.58 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  24.46 
 
 		 167 aa  40.8  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>