More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4911 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4911  inner-membrane translocator  100 
 
 		 316 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2494  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  65.57 
 
 		 307 aa  358  5e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.272138  hitchhiker  0.00284641 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0733  inner-membrane translocator  57.43 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.73446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1213  inner-membrane translocator  54.55 
 
 		 294 aa  279  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  40.2 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3908  inner-membrane translocator  39.54 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3795  inner-membrane translocator  39.54 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189427 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0333  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  38.23 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.94 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  36.09 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2269  inner-membrane translocator  36.95 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 317 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 372 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  38.27 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  38.27 
 
 		 350 aa  143  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.68 
 
 		 418 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.4 
 
 		 322 aa  142  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2266  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0901269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  37.12 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 415 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 393 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.01 
 
 		 423 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 376 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2955  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678807  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0474  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2252  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.09 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 357 aa  133  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 407 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.2 
 
 		 423 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1124  putative transport system permease protein  37.79 
 
 		 368 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101102  normal  0.0627537 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.2 
 
 		 427 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.2 
 
 		 427 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  32.53 
 
 		 389 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 389 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1471  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 353 aa  132  6.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0927911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  33.01 
 
 		 439 aa  132  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 331 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0482  ABC transporter permease  43.81 
 
 		 324 aa  132  7.999999999999999e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 384 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0045  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 389 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.05 
 
 		 418 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 407 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  36.22 
 
 		 610 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 353 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2016  inner-membrane translocator  36.06 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 358 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  35.77 
 
 		 399 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.28 
 
 		 389 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.28 
 
 		 389 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.96 
 
 		 389 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.28 
 
 		 389 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.28 
 
 		 389 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.28 
 
 		 389 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.28 
 
 		 389 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  35.77 
 
 		 398 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.38 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0613  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 345 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.17 
 
 		 317 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 315 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  35.77 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.74 
 
 		 418 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.84 
 
 		 421 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 454 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.74 
 
 		 418 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2752  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.74 
 
 		 418 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2430  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.106551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>