158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4767 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  57.76 
 
 
637 aa  705    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  53.19 
 
 
635 aa  665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 
629 aa  1252    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  55.2 
 
 
650 aa  691    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  45.11 
 
 
614 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4133  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.53 
 
 
840 aa  94.7  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.81 
 
 
512 aa  90.5  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  25.58 
 
 
523 aa  89.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1599  GTP-binding protein, HSR1-related  28.31 
 
 
500 aa  87.8  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.88 
 
 
291 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  28.06 
 
 
291 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  28.93 
 
 
290 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  28.93 
 
 
290 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  28.93 
 
 
290 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  28.43 
 
 
290 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  27.72 
 
 
444 aa  58.9  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  27.17 
 
 
291 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  28.43 
 
 
290 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  27.27 
 
 
295 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1032  GTP-binding protein Era  31.01 
 
 
296 aa  56.2  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  27.7 
 
 
437 aa  54.7  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1972  GTP-binding protein Era  27.49 
 
 
289 aa  54.7  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  32 
 
 
290 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  35.42 
 
 
328 aa  53.9  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05518  GTP binding protein (EngB), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13010)  27.32 
 
 
332 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  27 
 
 
449 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  31.09 
 
 
324 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  26.06 
 
 
434 aa  53.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5592  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.25 
 
 
198 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352235  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6542  small GTP-binding protein  28.81 
 
 
441 aa  51.6  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1172  GTP-binding protein EngA  32.81 
 
 
489 aa  51.2  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.120565  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  29.75 
 
 
433 aa  50.4  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  36.15 
 
 
427 aa  50.4  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0374  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.6 
 
 
254 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0899895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  26.73 
 
 
291 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0371  translation initiation factor IF-2  23.74 
 
 
896 aa  49.3  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0758  GTP-binding protein Era  27.97 
 
 
290 aa  49.3  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  31.01 
 
 
465 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  30.67 
 
 
454 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  31.45 
 
 
438 aa  49.7  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  29.17 
 
 
435 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  31.01 
 
 
465 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0763  GTP-binding protein Era  28.21 
 
 
291 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  22.79 
 
 
303 aa  48.5  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1369  GTP-binding protein EngA  28.33 
 
 
434 aa  48.5  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.911808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  33.88 
 
 
409 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0426  GTP-binding protein EngA  22.16 
 
 
442 aa  48.5  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000271389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1458  GTP-binding protein EngA  30.16 
 
 
487 aa  48.5  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961762  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0688  GTP-binding protein Era  28.21 
 
 
291 aa  48.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  30.89 
 
 
471 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1338  GTP-binding protein Era  28.21 
 
 
291 aa  48.5  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.548125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  33.83 
 
 
288 aa  48.5  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  25.91 
 
 
287 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  29.03 
 
 
438 aa  48.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1378  GTP-binding protein Era  28.93 
 
 
300 aa  48.1  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000347783  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  29.17 
 
 
303 aa  48.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  30.3 
 
 
305 aa  48.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  28.33 
 
 
439 aa  47.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  34.09 
 
 
490 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  30 
 
 
448 aa  47.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  27.27 
 
 
443 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  30.4 
 
 
500 aa  47.8  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2148  small GTP-binding protein  27.87 
 
 
495 aa  47.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 
516 aa  47.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  28.33 
 
 
439 aa  47.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  27.27 
 
 
441 aa  47.4  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1003  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 
289 aa  47.8  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  23.23 
 
 
463 aa  47.4  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  29.37 
 
 
315 aa  47.4  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2143  GTP-binding protein EngA  26.12 
 
 
437 aa  47.4  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  35.29 
 
 
355 aa  47.4  0.0009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  30 
 
 
585 aa  47.4  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1223  GTP-binding protein Era  23.78 
 
 
289 aa  47.4  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.225861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  28.23 
 
 
440 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1623  GTP-binding proten HflX  37.9 
 
 
408 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  30.33 
 
 
409 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  30.23 
 
 
465 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2751  GTP-binding protein, HSR1-related  28.16 
 
 
549 aa  47  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  0.205011 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  25.36 
 
 
444 aa  46.6  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  26.61 
 
 
441 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 
301 aa  46.6  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  27.12 
 
 
440 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  29.27 
 
 
602 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  25.24 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  25 
 
 
445 aa  47.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  32.26 
 
 
318 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  25.91 
 
 
287 aa  46.2  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  30.95 
 
 
302 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1651  GTP-binding protein EngA  30.58 
 
 
443 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2815  ribosome-associated GTPase EngA  29.85 
 
 
478 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.560303  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1165  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.33 
 
 
194 aa  45.8  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000846962  decreased coverage  3.27635e-26 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  30 
 
 
446 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  25.4 
 
 
997 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1423  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.24 
 
 
216 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.192754  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  24.82 
 
 
940 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  25.55 
 
 
1079 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  32.61 
 
 
446 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3805  hypothetical protein  21.25 
 
 
927 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3506  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 
927 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0255227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  34.25 
 
 
436 aa  45.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>