More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1032 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1032  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.238  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1378  GTP-binding protein Era  60.34 
 
 		 300 aa  357  9e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000347783  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1972  GTP-binding protein Era  53.98 
 
 		 289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1003  GTP-binding protein Era  50.88 
 
 		 289 aa  312  3.9999999999999997e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1223  GTP-binding protein Era  52.94 
 
 		 289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.225861  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0758  GTP-binding protein Era  49.65 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1060  GTP-binding protein Era  49.3 
 
 		 289 aa  293  3e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00411947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0763  GTP-binding protein Era  48.25 
 
 		 291 aa  279  4e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0688  GTP-binding protein Era  48.25 
 
 		 291 aa  279  5e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1338  GTP-binding protein Era  46.85 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.548125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  38.28 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  39.86 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  38.23 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  38.36 
 
 		 299 aa  205  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0507  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 301 aa  205  8e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000333853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  38.23 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  38.7 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  38.49 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  34.36 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  38.23 
 
 		 348 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  37.8 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  38.83 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  36.99 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  35.37 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  37.33 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  35.37 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  38.85 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  35.47 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  36.99 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  34.93 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  36.9 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  35.27 
 
 		 303 aa  188  7e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  34.81 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  36.12 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  37.29 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  38.78 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  34.36 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  34.69 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  34.35 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  36.24 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  35.23 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  36.43 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  35.62 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5260  GTP-binding protein Era  34.01 
 
 		 344 aa  185  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  38.51 
 
 		 300 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3060  GTP-binding protein Era  34.69 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  35.05 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  35.05 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3634  GTP-binding protein Era  34.26 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  34.72 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  35.71 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  33.9 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  33.9 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  35.37 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  34.71 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  34.36 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  32.66 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  34.36 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  36.49 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  34.47 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0864  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1008  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  35.37 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  34.13 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3237  GTP-binding protein Era  33.78 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  33.68 
 
 		 303 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  37.12 
 
 		 313 aa  178  8e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  35.62 
 
 		 301 aa  178  8e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  37.16 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  34.33 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  34.83 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1403  GTP-binding protein Era  35.69 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  33.9 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  33.76 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  34.48 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  34.92 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  34.72 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  33.78 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  36.52 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  37.88 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1197  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  36.09 
 
 		 314 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  35.27 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  34.45 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  36.09 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  35.35 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  33.79 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  34.14 
 
 		 299 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  34.14 
 
 		 299 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>