More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1378 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1378  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 300 aa  611  9.999999999999999e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000347783  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1032  GTP-binding protein Era  60.34 
 
 		 296 aa  375  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.238  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1972  GTP-binding protein Era  52.25 
 
 		 289 aa  311  7.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1223  GTP-binding protein Era  50.87 
 
 		 289 aa  295  6e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.225861  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0758  GTP-binding protein Era  51.04 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1060  GTP-binding protein Era  48.95 
 
 		 289 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00411947  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1003  GTP-binding protein Era  45.96 
 
 		 289 aa  279  4e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0763  GTP-binding protein Era  48.25 
 
 		 291 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0688  GTP-binding protein Era  48.25 
 
 		 291 aa  267  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1338  GTP-binding protein Era  47.2 
 
 		 291 aa  261  8e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.548125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  37.87 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 		 324 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  38.51 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  37.16 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  36.99 
 
 		 348 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  36.86 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3060  GTP-binding protein Era  36.43 
 
 		 357 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  36.05 
 
 		 299 aa  198  9e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3634  GTP-binding protein Era  35.99 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  38.38 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  39.19 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 		 296 aa  195  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  36.82 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  36.82 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  36.64 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  35.27 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  37.07 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  37.25 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 		 315 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  34.01 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  37.07 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  34.14 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  37.07 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  37.76 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  38.23 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  37.88 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  37.07 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  37.07 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  37.07 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  37.07 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  37.07 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  35.1 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  38.83 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  37.71 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  34.01 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  33.9 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  36.36 
 
 		 303 aa  188  7e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  34.01 
 
 		 468 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  34.08 
 
 		 313 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  36.39 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  36.39 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  36.15 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  35.71 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  33.89 
 
 		 298 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 		 449 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  34 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  33.9 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 		 489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  34.71 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  39.25 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  34.46 
 
 		 300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  38.91 
 
 		 300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  35.03 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  35.67 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  34.78 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  39.39 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  33.89 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  31.08 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  32.76 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1403  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  33.45 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2185  GTP-binding protein Era  31.97 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646134  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  33 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5260  GTP-binding protein Era  33 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 337 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  34.01 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 337 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  34.59 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  35.27 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  35.27 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  34.77 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  36.45 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  34.01 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  34.02 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  34.95 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  34.55 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  35.27 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  34.95 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  35.1 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  39.12 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3237  GTP-binding protein Era  32.67 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  34.48 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>