More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1972 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1972  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 289 aa  589  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1223  GTP-binding protein Era  77.16 
 
 		 289 aa  473  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.225861  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1003  GTP-binding protein Era  62.46 
 
 		 289 aa  387  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0758  GTP-binding protein Era  58.89 
 
 		 290 aa  359  3e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1060  GTP-binding protein Era  57.79 
 
 		 289 aa  356  1.9999999999999998e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00411947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0763  GTP-binding protein Era  59.23 
 
 		 291 aa  340  1e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0688  GTP-binding protein Era  59.23 
 
 		 291 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1338  GTP-binding protein Era  57.99 
 
 		 291 aa  328  5.0000000000000004e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.548125  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1032  GTP-binding protein Era  53.98 
 
 		 296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.238  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1378  GTP-binding protein Era  52.25 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000347783  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  38.23 
 
 		 348 aa  201  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  37.88 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  36.08 
 
 		 294 aa  195  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  37.29 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  38.23 
 
 		 299 aa  191  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  38.31 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  36.99 
 
 		 297 aa  188  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  36.9 
 
 		 299 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  35.47 
 
 		 314 aa  188  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  36.9 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  37.11 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  37.11 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  37.2 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  34.59 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  36.3 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1015  GTP-binding protein Era  36.71 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5260  GTP-binding protein Era  35.25 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  34.15 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  36.43 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  38.7 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1093  GTP-binding protein Era  37.06 
 
 		 287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3237  GTP-binding protein Era  34.58 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  35.4 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  36.73 
 
 		 296 aa  182  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1086  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  35.4 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2898  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22233  normal  0.295103 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0864  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1008  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  35.15 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  36.39 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  36.3 
 
 		 299 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  35.15 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  35.15 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 303 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  37.11 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  34.05 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  36.86 
 
 		 332 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  32.33 
 
 		 310 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  32.75 
 
 		 308 aa  178  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  35.15 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  36.3 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  35.81 
 
 		 311 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  36.3 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  34.24 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  33.79 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1403  GTP-binding protein Era  35.93 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  34.24 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  32.29 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3060  GTP-binding protein Era  34.48 
 
 		 357 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  32.31 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  35.17 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1197  GTP-binding protein Era  34.24 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  34.13 
 
 		 303 aa  175  6e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  32.67 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3634  GTP-binding protein Era  34.48 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  34.39 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  35.52 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  35.27 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  35.4 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  35.59 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  33.79 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  32.53 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  35.52 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  35.59 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02424  hypothetical protein  36.77 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2742  GTP-binding protein Era  36.55 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2958  GTP-binding protein Era  36.55 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435183  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>