More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1223 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1223  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 289 aa  587  1e-166  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.225861  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1972  GTP-binding protein Era  77.16 
 
 		 289 aa  473  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1003  GTP-binding protein Era  59.64 
 
 		 289 aa  363  2e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0758  GTP-binding protein Era  58.89 
 
 		 290 aa  345  6e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1060  GTP-binding protein Era  56.06 
 
 		 289 aa  340  1e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00411947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0763  GTP-binding protein Era  58.89 
 
 		 291 aa  335  7e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0688  GTP-binding protein Era  58.89 
 
 		 291 aa  334  7.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1338  GTP-binding protein Era  58.33 
 
 		 291 aa  326  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.548125  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1032  GTP-binding protein Era  52.94 
 
 		 296 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.238  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1378  GTP-binding protein Era  50.87 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000347783  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  36.99 
 
 		 324 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  38.1 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  36.39 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  36.95 
 
 		 297 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  38.57 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  34.81 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  35.96 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  35.62 
 
 		 296 aa  175  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  36.52 
 
 		 296 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  32.99 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  34.41 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  33.78 
 
 		 314 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  36.52 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  35.52 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  36.03 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  35.84 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  36.05 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  35.47 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  35.47 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  35.47 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  35.47 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5260  GTP-binding protein Era  33.9 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  35.47 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  34.48 
 
 		 300 aa  168  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  33.9 
 
 		 315 aa  168  9e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  34.13 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3060  GTP-binding protein Era  34.14 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3634  GTP-binding protein Era  34.48 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  33.9 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  31.01 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  34.26 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  34.26 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  33.79 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  35.14 
 
 		 338 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  34.8 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  36.17 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  35.02 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  33.9 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  34.26 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  34.26 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  34.26 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  34.26 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  34.26 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  35.15 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  35 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  35.59 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  33.79 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  35.81 
 
 		 330 aa  165  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  34.95 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  33.22 
 
 		 337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  31.44 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  33.22 
 
 		 337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  35.49 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1197  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  34.8 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1403  GTP-binding protein Era  35.35 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  34.8 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  34.8 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  33.91 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  35.02 
 
 		 329 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  33.67 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  33.67 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 301 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  32.77 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  33.1 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  33.1 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  33.45 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  33.1 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  33.1 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  33.1 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  33.1 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  35.69 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  33.45 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  34.8 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1015  GTP-binding protein Era  33.8 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 299 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  33.91 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0507  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000333853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  34.77 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  35.14 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  34.12 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  34.35 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>