More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4297 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
357 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  76.75 
 
 
358 aa  554  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  75 
 
 
357 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  72.27 
 
 
357 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  71.99 
 
 
357 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  72.88 
 
 
364 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.26 
 
 
358 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  54.8 
 
 
355 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.18 
 
 
356 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.65 
 
 
356 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.12 
 
 
356 aa  364  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.97 
 
 
354 aa  360  2e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.28 
 
 
355 aa  360  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.14 
 
 
355 aa  359  4e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.4 
 
 
355 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.03 
 
 
357 aa  353  2e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.01 
 
 
355 aa  349  3e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.88 
 
 
358 aa  349  4e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.15 
 
 
355 aa  348  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.86 
 
 
376 aa  348  9e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.9 
 
 
357 aa  347  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.73 
 
 
355 aa  347  1e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.15 
 
 
355 aa  347  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.22 
 
 
359 aa  342  4e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  48.31 
 
 
355 aa  338  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.03 
 
 
355 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.5 
 
 
355 aa  332  9e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  46.63 
 
 
355 aa  325  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.3 
 
 
355 aa  300  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.18 
 
 
357 aa  298  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.69 
 
 
349 aa  296  4e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.23 
 
 
357 aa  294  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.3 
 
 
354 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.26 
 
 
353 aa  279  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.01 
 
 
355 aa  276  6e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.95 
 
 
358 aa  275  9e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.89 
 
 
354 aa  266  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.66 
 
 
344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.33 
 
 
351 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  36.5 
 
 
396 aa  192  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.28 
 
 
397 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  34.57 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.71 
 
 
245 aa  175  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.44 
 
 
320 aa  175  9e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.68 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1373  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.71 
 
 
245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.24 
 
 
299 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  39.74 
 
 
243 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.08 
 
 
296 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1351  Nucleotidyl transferase  35.89 
 
 
257 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.86 
 
 
245 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  35.86 
 
 
245 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.86 
 
 
245 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.86 
 
 
245 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.86 
 
 
245 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.86 
 
 
245 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4118  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
290 aa  169  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00952178  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3859  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
290 aa  169  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  35.86 
 
 
245 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.1 
 
 
400 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.86 
 
 
245 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  35.53 
 
 
400 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3848  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.33 
 
 
286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4076  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0532179  normal  0.23652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 
289 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 
296 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 
294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2672  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 
296 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00250825  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3841  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
290 aa  166  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.43 
 
 
240 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.52 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494959  normal  0.263713 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.71 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1450  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.52 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2119  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.14 
 
 
300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.39 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.03 
 
 
405 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0188  nucleotidyl transferase  39.41 
 
 
244 aa  164  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.49 
 
 
291 aa  164  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2629  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.71 
 
 
298 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.357597  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.17 
 
 
298 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 
296 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.33 
 
 
293 aa  162  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.76 
 
 
293 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.29 
 
 
297 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2354  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.48 
 
 
296 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.29 
 
 
297 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.71 
 
 
297 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.29 
 
 
297 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.24 
 
 
292 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.97 
 
 
296 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0244  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  34.44 
 
 
294 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0179  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  34.44 
 
 
294 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1315  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.25 
 
 
291 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3286  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.63 
 
 
288 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
296 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.42 
 
 
294 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.82 
 
 
295 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  37.07 
 
 
253 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>