More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5838 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 		 295 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494959  normal  0.263713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1450  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  98.26 
 
 		 306 aa  578  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  91 
 
 		 296 aa  544  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  85.42 
 
 		 296 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  85.42 
 
 		 296 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  85.02 
 
 		 289 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  85.07 
 
 		 294 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  84.38 
 
 		 299 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2354  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  85.42 
 
 		 296 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2672  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  85.07 
 
 		 296 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00250825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.44 
 
 		 292 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0625  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.45 
 
 		 290 aa  397  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.23 
 
 		 296 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.51 
 
 		 293 aa  391  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.38 
 
 		 296 aa  386  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.942362  decreased coverage  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0702  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.28 
 
 		 307 aa  384  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00504967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4056  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.07 
 
 		 296 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.34 
 
 		 295 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0621  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.02 
 
 		 293 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.15 
 
 		 305 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1299  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.98 
 
 		 291 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5902  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.79 
 
 		 293 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.25 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.23 
 
 		 292 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.79 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0399407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.85 
 
 		 290 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0555  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.69 
 
 		 296 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  65.02 
 
 		 292 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.92 
 
 		 296 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.48 
 
 		 298 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.17 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15940  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.32 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.42 
 
 		 296 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  61.05 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.48 
 
 		 298 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1270  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.19 
 
 		 289 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106852  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1494  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.68 
 
 		 287 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.34 
 
 		 296 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.4 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.49 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.28241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3556  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.73 
 
 		 294 aa  371  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305082  normal  0.867096 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.76 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112189  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2677  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 		 292 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1983  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.32 
 
 		 287 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.82 
 
 		 292 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.6 
 
 		 292 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.35 
 
 		 297 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3121  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.98 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2131  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.49 
 
 		 297 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60 
 
 		 291 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0322301 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2858  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0450568  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2458  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.76 
 
 		 291 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3386  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.14 
 
 		 298 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1449  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.08 
 
 		 291 aa  371  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.99 
 
 		 297 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.97 
 
 		 293 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1399  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.86 
 
 		 290 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3489  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.68 
 
 		 295 aa  371  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.374251 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0762  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.32 
 
 		 297 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0478  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.42 
 
 		 293 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  59.86 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.99 
 
 		 297 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60 
 
 		 293 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0626  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.66 
 
 		 294 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.353924 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1470  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.99 
 
 		 312 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0517  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60 
 
 		 293 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4028  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0696  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.62 
 
 		 294 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2899  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.58 
 
 		 287 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03667  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.63 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.63 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4006  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.63 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.63 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.62 
 
 		 294 aa  364  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.057049 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03616  hypothetical protein  60.63 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0865  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  57.99 
 
 		 294 aa  366  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000171087 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2101  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.27 
 
 		 294 aa  364  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.21 
 
 		 294 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.21 
 
 		 297 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3801  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.94 
 
 		 292 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0639  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.94 
 
 		 294 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.477683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2318  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.97 
 
 		 297 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4132  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.63 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.63 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.671584  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.27 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.62 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.65 
 
 		 289 aa  364  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.310491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2263  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.58 
 
 		 305 aa  364  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.63 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.23 
 
 		 309 aa  363  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3162  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.63 
 
 		 312 aa  363  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3970  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.32 
 
 		 297 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00629806  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1715  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.97 
 
 		 297 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.703429 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1798  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.23 
 
 		 287 aa  364  1e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5222  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.28 
 
 		 293 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0123  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.63 
 
 		 291 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.63 
 
 		 297 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0791129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3140  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.63 
 
 		 297 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0879  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.97 
 
 		 297 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>