More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0457 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
334 aa  644    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.4 
 
 
328 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1826  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.11 
 
 
334 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.11 
 
 
334 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1892  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.11 
 
 
334 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.114167  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
338 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 
333 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
337 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.678107  normal  0.316578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
336 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.721542  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  36.34 
 
 
339 aa  202  7e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5375  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.47 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296899  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 
337 aa  200  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.87 
 
 
336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
335 aa  199  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
334 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.59 
 
 
337 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
344 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.7 
 
 
364 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
336 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
335 aa  194  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  36.98 
 
 
336 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  37.22 
 
 
336 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  36.53 
 
 
337 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
361 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  36.98 
 
 
336 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  37.98 
 
 
339 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  37.98 
 
 
339 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  38.32 
 
 
336 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
347 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.34 
 
 
334 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  36.98 
 
 
336 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  36.98 
 
 
336 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  37.5 
 
 
339 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.28 
 
 
336 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  37.2 
 
 
339 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.98 
 
 
336 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
335 aa  191  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
335 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268081  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
337 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
333 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.69 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
341 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
356 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
356 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  37.13 
 
 
336 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2947  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.98 
 
 
338 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.728806  normal  0.808903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1252  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  39.24 
 
 
356 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
364 aa  188  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3887  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  36.99 
 
 
355 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
313 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  36.28 
 
 
336 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.56 
 
 
356 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0210654  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
306 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.09 
 
 
335 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
335 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  36.8 
 
 
351 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
318 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
334 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
316 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00000000419237  n/a   
 
 
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
336 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
336 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1443  ABC transporter, permease protein  38.61 
 
 
330 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
356 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
356 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00157663  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  35.99 
 
 
336 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
341 aa  186  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  36.8 
 
 
339 aa  186  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
356 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.076951 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
313 aa  185  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
341 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
341 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  35.69 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  36.91 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01444  D-ala-D-ala transporter subunit  38.65 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.982069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162218  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0198405  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2098  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  38.65 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1687  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  38.65 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.930254  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01456  hypothetical protein  38.65 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.34 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1675  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  38.65 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.925292  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11441  putative ABC transporter of oligopeptides  34.97 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.333035  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  36.42 
 
 
335 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
329 aa  183  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  35.99 
 
 
336 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
336 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
336 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
336 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  38.1 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  35.22 
 
 
337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>