More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0233 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0233  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 310 aa  616  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  72.22 
 
 		 313 aa  431  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.97 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.12 
 
 		 299 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  46.67 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  49.83 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  47.18 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.04 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  45.51 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  48.85 
 
 		 309 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  49.34 
 
 		 303 aa  252  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  48.01 
 
 		 315 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.38 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.73 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.38 
 
 		 303 aa  246  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  47.96 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  47.62 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.38 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.67 
 
 		 303 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.72 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.38 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  44.66 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.5 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.82 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  45.82 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.38 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.82 
 
 		 299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.05 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.05 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.05 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2384  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.15 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953332 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  46.33 
 
 		 313 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1943  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.82 
 
 		 299 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483934  hitchhiker  0.000417953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  47.68 
 
 		 309 aa  238  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  47.04 
 
 		 328 aa  238  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  44.44 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5964  pyruvate carboxyltransferase  43.89 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0367175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  45.89 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.5 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  49.67 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4349  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.15 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  42.71 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.14 
 
 		 299 aa  235  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  44.82 
 
 		 301 aa  235  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  45.97 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  44 
 
 		 327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3757  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.48 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0122709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  48.84 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3354  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.18 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  46.15 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3038  pyruvate carboxyltransferase  43.81 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.928882  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2536  pyruvate carboxyltransferase  44.93 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  46.15 
 
 		 320 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  42.07 
 
 		 305 aa  232  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  46.15 
 
 		 320 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  47.51 
 
 		 317 aa  232  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.3 
 
 		 336 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  42.96 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  43.84 
 
 		 302 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  48.34 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2471  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.48 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.54 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  46.86 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0477  pyruvate carboxyltransferase  42.76 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  42.05 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  43.43 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.95 
 
 		 299 aa  229  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2932  pyruvate carboxyltransferase  44.93 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0514  pyruvate carboxyltransferase  43.49 
 
 		 303 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00792422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4710  pyruvate carboxyltransferase  42.81 
 
 		 306 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0633  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40 
 
 		 299 aa  228  9e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  41.95 
 
 		 296 aa  228  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.28 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2762  pyruvate carboxyltransferase  44.44 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2810  pyruvate carboxyltransferase  44.59 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.631686  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1542  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.131196  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.45 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4155  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.2 
 
 		 306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  44.7 
 
 		 315 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  39.93 
 
 		 302 aa  225  7e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  41.95 
 
 		 296 aa  225  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1526  pyruvate carboxyltransferase  42.57 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2977  pyruvate carboxyltransferase  42.57 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  42.57 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  39.54 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  42.37 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  43.88 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0343  pyruvate carboxyltransferase  42.19 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  39.6 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.67 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  47.35 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1462  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.52 
 
 		 317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4049  pyruvate carboxyltransferase  48.5 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal  0.299101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0086  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.02 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.22 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2063  pyruvate carboxyltransferase  40.94 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  43.43 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00102  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.18 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  42.09 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.6 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>