55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3072 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 		 253 aa  526  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  39.68 
 
 		 247 aa  214  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  37.6 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  28.79 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  29.48 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  27.13 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  30.2 
 
 		 255 aa  125  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  28.17 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  27.87 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  29.8 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  33.18 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  32.27 
 
 		 246 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  31.87 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  30.2 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  27.88 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  26.89 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  25 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  27.83 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  27.83 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  29.47 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  27.23 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  25.47 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  26.67 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  30.14 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  29.6 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  24.5 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  25.91 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  26.49 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  21.76 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  25.79 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  23.48 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  26.48 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  23.4 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  27.23 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  27.98 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1403  Acyl-ACP thioesterase  31.61 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  24.53 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2369  acyl-ACP thioesterase  24.76 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.111453  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  21.61 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2218  hypothetical protein  23.11 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23720  acyl-ACP thioesterase  20.94 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10473  hypothetical protein  20 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  22.79 
 
 		 154 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0797  acyl-ACP thioesterase  22.58 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  26.17 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 		 145 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  22.9 
 
 		 129 aa  42.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  25.17 
 
 		 149 aa  42.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  20.74 
 
 		 140 aa  42  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0648  acyl-ACP thioesterase  20.11 
 
 		 271 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0635  acyl-ACP thioesterase  20.11 
 
 		 271 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0628  acyl-ACP thioesterase  20.11 
 
 		 271 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  25.23 
 
 		 163 aa  42  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>