21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10473 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10473  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0635  acyl-ACP thioesterase  77.1 
 
 
271 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0648  acyl-ACP thioesterase  77.1 
 
 
271 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0628  acyl-ACP thioesterase  77.1 
 
 
271 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0800  acyl-ACP thioesterase  73.28 
 
 
271 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270685  normal  0.871295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0108  acyl-ACP thioesterase  71.59 
 
 
284 aa  407  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12033  hypothetical protein  38.71 
 
 
250 aa  175  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2558  acyl-ACP thioesterase  41.26 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.203443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3503  acyl-ACP thioesterase  39.61 
 
 
284 aa  171  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1488  acyl-ACP thioesterase  40.41 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3879  acyl-ACP thioesterase  40.27 
 
 
285 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0797  acyl-ACP thioesterase  25.57 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  26.67 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  20.1 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  23.77 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  22.4 
 
 
295 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  20 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  22.33 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  20.75 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  21.91 
 
 
241 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  19.74 
 
 
242 aa  43.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>