18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0635 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0635  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 
271 aa  557  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0648  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 
271 aa  557  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0628  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 
271 aa  557  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0800  acyl-ACP thioesterase  84.5 
 
 
271 aa  481  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270685  normal  0.871295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0108  acyl-ACP thioesterase  82.13 
 
 
284 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10473  hypothetical protein  77.1 
 
 
264 aa  428  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12033  hypothetical protein  39.18 
 
 
250 aa  187  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2558  acyl-ACP thioesterase  37.38 
 
 
258 aa  168  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.203443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3503  acyl-ACP thioesterase  39.61 
 
 
284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1488  acyl-ACP thioesterase  40.91 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3879  acyl-ACP thioesterase  39.37 
 
 
285 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0797  acyl-ACP thioesterase  28.88 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  25.56 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  25.41 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  23.08 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  21.5 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  19.88 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
136 aa  42.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>