15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12033 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12033  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2558  acyl-ACP thioesterase  62.7 
 
 
258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.203443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0635  acyl-ACP thioesterase  39.18 
 
 
271 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0648  acyl-ACP thioesterase  39.18 
 
 
271 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0628  acyl-ACP thioesterase  39.18 
 
 
271 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0108  acyl-ACP thioesterase  37.14 
 
 
284 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1488  acyl-ACP thioesterase  38.53 
 
 
268 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3879  acyl-ACP thioesterase  39.76 
 
 
285 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10473  hypothetical protein  38.71 
 
 
264 aa  175  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0800  acyl-ACP thioesterase  38.83 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270685  normal  0.871295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3503  acyl-ACP thioesterase  36.56 
 
 
284 aa  171  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0797  acyl-ACP thioesterase  23.73 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  26.95 
 
 
254 aa  48.5  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  22.33 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  22.99 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>