16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2558 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2558  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 
258 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.203443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12033  hypothetical protein  62.7 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0108  acyl-ACP thioesterase  40.78 
 
 
284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0800  acyl-ACP thioesterase  37.86 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270685  normal  0.871295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10473  hypothetical protein  41.26 
 
 
264 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1488  acyl-ACP thioesterase  40.76 
 
 
268 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0635  acyl-ACP thioesterase  37.38 
 
 
271 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0648  acyl-ACP thioesterase  37.38 
 
 
271 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0628  acyl-ACP thioesterase  37.38 
 
 
271 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3503  acyl-ACP thioesterase  38.97 
 
 
284 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3879  acyl-ACP thioesterase  39 
 
 
285 aa  165  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0797  acyl-ACP thioesterase  22.58 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  19.88 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  17.87 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  23.64 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  22.89 
 
 
241 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>