15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1488 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1488  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 		 268 aa  544  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12033  hypothetical protein  38.53 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2558  acyl-ACP thioesterase  40.76 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.203443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0635  acyl-ACP thioesterase  40.91 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0648  acyl-ACP thioesterase  40.91 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0628  acyl-ACP thioesterase  40.91 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0800  acyl-ACP thioesterase  39.05 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270685  normal  0.871295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0108  acyl-ACP thioesterase  40.89 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10473  hypothetical protein  40.41 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3503  acyl-ACP thioesterase  36.51 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3879  acyl-ACP thioesterase  34.41 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0797  acyl-ACP thioesterase  31.52 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  24.71 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  28.3 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  23.12 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>