21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0797 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0797  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 
249 aa  485  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0108  acyl-ACP thioesterase  29.6 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0800  acyl-ACP thioesterase  28.29 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270685  normal  0.871295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0635  acyl-ACP thioesterase  28.88 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0648  acyl-ACP thioesterase  28.88 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0628  acyl-ACP thioesterase  28.88 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10473  hypothetical protein  25.57 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1488  acyl-ACP thioesterase  31.52 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3503  acyl-ACP thioesterase  28.23 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12033  hypothetical protein  23.73 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2558  acyl-ACP thioesterase  22.58 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.203443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3879  acyl-ACP thioesterase  27.38 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  24.4 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  23.81 
 
 
295 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  26.47 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  25.14 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  26.06 
 
 
252 aa  45.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  23.6 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  28.34 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  22.58 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  28.41 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>