More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0734 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  100 
 
 		 373 aa  756    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  46.93 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  35.34 
 
 		 375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  38.3 
 
 		 379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  34.49 
 
 		 379 aa  219  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  35.4 
 
 		 379 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  33.77 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  34.19 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  32.55 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  29.4 
 
 		 374 aa  190  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  32.36 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  32.35 
 
 		 377 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  34.65 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  31.83 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  32.33 
 
 		 399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  51.72 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  33.77 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  30.03 
 
 		 404 aa  169  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  31.79 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  28.12 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  28.75 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  29.28 
 
 		 469 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  27.48 
 
 		 441 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  38.87 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  47.06 
 
 		 375 aa  149  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  29.57 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  42.65 
 
 		 452 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  41.15 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  50 
 
 		 367 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  53.28 
 
 		 282 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  34.8 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  48.41 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  49.22 
 
 		 271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  49.22 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  49.22 
 
 		 324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  33.21 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  31.98 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.85 
 
 		 304 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  49.59 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  38.15 
 
 		 305 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  40.11 
 
 		 247 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  37.57 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  46.88 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  37.57 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  43.55 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  45.83 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  44.27 
 
 		 582 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  49.61 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  48.03 
 
 		 265 aa  123  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  27.27 
 
 		 394 aa  123  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  46.83 
 
 		 332 aa  122  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  40.11 
 
 		 223 aa  122  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  47.93 
 
 		 248 aa  122  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  46.67 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  44.63 
 
 		 274 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  47.9 
 
 		 523 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  43.94 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  28.45 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  45.08 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  40.24 
 
 		 238 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  41.21 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  40.94 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  45 
 
 		 735 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  47.93 
 
 		 490 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  42.74 
 
 		 455 aa  120  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  43.55 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  46.72 
 
 		 419 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  38.92 
 
 		 482 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  28.33 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  47.58 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  38.18 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  40.98 
 
 		 538 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  26.58 
 
 		 430 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  48.28 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  45.97 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  26.25 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  42.74 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  44.35 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  41.94 
 
 		 456 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  42.15 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  41.6 
 
 		 447 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  41.6 
 
 		 447 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  35.37 
 
 		 450 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  36.77 
 
 		 230 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  45.69 
 
 		 369 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  37.79 
 
 		 468 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  44.83 
 
 		 665 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  41.94 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  48.78 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  42.74 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  31.91 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  41.6 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  45.3 
 
 		 527 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  45.53 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  41.94 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  46.72 
 
 		 695 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  46.51 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  47.5 
 
 		 448 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  46.28 
 
 		 472 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  28.57 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>