118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0193 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0193  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 394 aa  751    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3197  sodium/hydrogen exchanger  61.79 
 
 		 391 aa  456  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000344959  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  47.96 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0270  sodium/hydrogen exchanger  49.74 
 
 		 400 aa  325  7e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1529  sodium/hydrogen exchanger  42.13 
 
 		 503 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3111  sodium/hydrogen exchanger  46.36 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000824463  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  40.26 
 
 		 396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2353  hypothetical protein  39.41 
 
 		 541 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  39.75 
 
 		 543 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2186  Na+/H+-exchanging protein  37.03 
 
 		 545 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.601594 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40732  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  33.77 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00131155 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30420  predicted protein  28.98 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.726911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  28.57 
 
 		 611 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  28.37 
 
 		 611 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 651 aa  69.7  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  24.55 
 
 		 602 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  28.52 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  27.99 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  23.75 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  25.35 
 
 		 741 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  26.59 
 
 		 601 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  22.69 
 
 		 597 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  24.11 
 
 		 637 aa  63.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  22.8 
 
 		 597 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.24 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 		 608 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  25.77 
 
 		 619 aa  60.1  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.07 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  23.5 
 
 		 612 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  26.3 
 
 		 601 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1412  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.97 
 
 		 574 aa  58.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 		 602 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  22.47 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  26.59 
 
 		 601 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  23.06 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  25.45 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  23.64 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  22.59 
 
 		 599 aa  57.4  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  24.28 
 
 		 760 aa  57  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  26.7 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 622 aa  56.6  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  24.66 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  28.79 
 
 		 617 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  24.87 
 
 		 445 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  25.2 
 
 		 574 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  22.34 
 
 		 597 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  22.68 
 
 		 598 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  25.25 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  23.02 
 
 		 641 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  30.5 
 
 		 599 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 		 637 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  27.59 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  24.59 
 
 		 598 aa  50.1  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  23.75 
 
 		 610 aa  49.7  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  22.98 
 
 		 597 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  24.05 
 
 		 573 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  23.37 
 
 		 498 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  28.89 
 
 		 616 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0895  sodium/hydrogen exchanger  28.69 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  25.44 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  37.5 
 
 		 689 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  25.44 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  25.44 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  26.05 
 
 		 611 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  25.44 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  23.81 
 
 		 652 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  25.44 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1304  sodium/hydrogen exchanger  23.56 
 
 		 435 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  24.15 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1574  sodium/hydrogen exchanger  27.34 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  23.63 
 
 		 652 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2757  potassium/proton antiporter  22.75 
 
 		 538 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  24.19 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  21.12 
 
 		 592 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  24.32 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  25 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  22.94 
 
 		 531 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  25.16 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  23.45 
 
 		 1247 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  23.93 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  23.01 
 
 		 625 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  24 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  21.61 
 
 		 404 aa  46.2  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.81 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.68 
 
 		 578 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  24.22 
 
 		 604 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  25.19 
 
 		 606 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  25.27 
 
 		 607 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  25.44 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  38.89 
 
 		 679 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.08 
 
 		 666 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.38 
 
 		 669 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  34.12 
 
 		 712 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  30.12 
 
 		 716 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 		 751 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0483  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 		 419 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 		 771 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>