197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1499 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1499  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 
339 aa  662    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1450  sodium/calcium exchanger membrane region  56.78 
 
 
355 aa  316  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879027  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3907  sodium/calcium exchanger membrane region  49.38 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.93815 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1223  Sodium/calcium exchanger membrane region  46.85 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12780  Ca2+/Na+ antiporter  48.04 
 
 
345 aa  250  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63097  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1849  sodium/calcium exchanger membrane region  46.32 
 
 
361 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.353414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0538  sodium/calcium exchanger membrane region  44.44 
 
 
347 aa  238  9e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0449  sodium/calcium exchanger membrane region  45.12 
 
 
347 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.589797  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4761  sodium/calcium exchanger membrane region  26.07 
 
 
357 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4299  sodium/calcium exchanger membrane region  28.95 
 
 
357 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3609  sodium/calcium exchanger membrane region  29.82 
 
 
336 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.722589 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0274  sodium/calcium exchanger membrane region  26.22 
 
 
343 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1175  sodium/calcium exchanger membrane region  26.14 
 
 
348 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.606796  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1122  sodium/calcium exchanger membrane region  28 
 
 
338 aa  96.3  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2147  sodium/calcium exchanger membrane region  27.96 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6944  sodium/calcium exchanger membrane region  27.73 
 
 
315 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2983  sodium/calcium exchanger membrane region  30.57 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39585  normal  0.0260778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3831  cation antiporter (Na+/Ca2+)  29.67 
 
 
334 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1133  sodium/calcium exchanger membrane protein  28 
 
 
334 aa  87.8  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000089866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3080  sodium/calcium exchanger membrane protein  28.24 
 
 
334 aa  86.3  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.036167  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0850  cation transporter, putative  27.36 
 
 
340 aa  85.9  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.495798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0501  Ca2+/H+ antiporter  27.61 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0384  sodium/calcium exchanger membrane region  25.93 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20130  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  28.52 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  29.45 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  29.27 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  29.27 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  29.27 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3670  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  29.34 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000078626 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.98 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.63 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.97 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  27.08 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.45 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2051  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.5 
 
 
324 aa  63.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  27.11 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  26.22 
 
 
321 aa  63.5  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1616  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  31.4 
 
 
312 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  27.57 
 
 
332 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  25.74 
 
 
309 aa  63.2  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0004  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  24.9 
 
 
364 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  22.55 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06231  CaCA family sodium/calcium exchanger  26 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.379015  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0549  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.19 
 
 
324 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.240591 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3921  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  30.83 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  21.68 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03659  hypothetical protein  26.27 
 
 
321 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0115  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.27 
 
 
320 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00802895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0831  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.86 
 
 
314 aa  60.1  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00973668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3291  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.17 
 
 
321 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0788949  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3651  putative calcium/sodium:proton antiporter  25.27 
 
 
320 aa  59.7  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0308  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.12 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002408  YrbG protein  24.9 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.411327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2006  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.94 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0642  Na+/Ca+ antiporter  27.11 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.67 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1799  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.97 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.43 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2279  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  28.74 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3632  putative calcium/sodium:proton antiporter  26.48 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.48 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.27 
 
 
322 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2414  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.74 
 
 
332 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3173  putative sodium/calcium exchanger protein  25.37 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222381  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  30 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  23.43 
 
 
316 aa  57.4  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.19 
 
 
357 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  25.85 
 
 
322 aa  57.4  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0590  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  28.08 
 
 
296 aa  57.4  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2262  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.79 
 
 
328 aa  57  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.436095  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2109  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  33.33 
 
 
322 aa  57  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.125049  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1539  inner membrane protein  43.42 
 
 
318 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.544691  normal  0.292097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  28.92 
 
 
334 aa  56.2  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  24.6 
 
 
326 aa  56.2  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  28.86 
 
 
323 aa  56.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2409  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.38 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0267872  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.33 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0509  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.57 
 
 
324 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0752  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.67 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.31 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.31 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.31 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.31 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3611  putative calcium/sodium:proton antiporter  38.61 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.297385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.07 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3673  putative calcium/sodium:proton antiporter  38.61 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.074393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.27 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2224  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  36.28 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  23.36 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.31 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3575  putative calcium/sodium:proton antiporter  38.61 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3506  putative calcium/sodium:proton antiporter  38.61 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3504  putative calcium/sodium:proton antiporter  38.61 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.316714  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1784  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.56 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000163312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0833  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger protein  31.73 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168882  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.93 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3809  putative calcium/sodium:proton antiporter  26.98 
 
 
320 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112683  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.84 
 
 
319 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.56 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.011039  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.34 
 
 
314 aa  53.5  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>