More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0156 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0156  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0415  ABC transporter extracellular solute-binding protein  44.49 
 
 		 276 aa  230  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4558  extracellular solute-binding protein  36.86 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.776949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1064  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.34 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00655066  normal  0.28594 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6090  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.574363 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4844  extracellular solute-binding protein family 3  35.52 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  0.095648 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1819  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  35.91 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309777  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5110  extracellular solute-binding protein  35.51 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539737  hitchhiker  0.00536253 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1147  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.421653 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6445  extracellular solute-binding protein family 3  32.05 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0216332 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4637  extracellular solute-binding protein family 3  31.01 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1953  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.41 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450219  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1879  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.41 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02131  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.96 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5967  ABC-type amino acid transport/signal transduction periplasmic protein  32.41 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  30.62 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 290 aa  119  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  30.23 
 
 		 256 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  30.94 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  29.2 
 
 		 271 aa  115  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.51 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0716  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 272 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1295  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.914061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  27.01 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  28.24 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  31.4 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  27.34 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  28.74 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  28.62 
 
 		 266 aa  105  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  29.12 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  27.8 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  26.99 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  26.28 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  28.74 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  28.68 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  30.99 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  28.68 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  28.68 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  30.17 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  30.17 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  27.97 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  27.48 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  27.85 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  26.3 
 
 		 265 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  27 
 
 		 266 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  27 
 
 		 266 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  27 
 
 		 266 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 266 aa  99  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  27.97 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  27.14 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.48 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 252 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  28.87 
 
 		 266 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 270 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  27.78 
 
 		 268 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 260 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  26.23 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.69 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.34 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.79 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.79 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.79 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.79 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.79 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.79 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.79 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.2 
 
 		 256 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.21 
 
 		 264 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 264 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  23.68 
 
 		 264 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 247 aa  92.4  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  27.39 
 
 		 273 aa  92.4  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  26.96 
 
 		 274 aa  92.4  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.41 
 
 		 513 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 254 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  25.11 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.68 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  26.13 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  24.24 
 
 		 254 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  27.16 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 264 aa  90.5  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>