211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5633 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5633  protein of unknown function DUF179  100 
 
 		 146 aa  300  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591685  normal  0.939371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  37.67 
 
 		 186 aa  107  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  40.31 
 
 		 186 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 186 aa  101  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  35.66 
 
 		 184 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  32.62 
 
 		 209 aa  97.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  30.56 
 
 		 187 aa  93.6  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  37.59 
 
 		 189 aa  92.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  32.64 
 
 		 187 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  35.77 
 
 		 187 aa  91.3  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  31.94 
 
 		 187 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  32.37 
 
 		 187 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  29.29 
 
 		 187 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  30.28 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  27.74 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  30.83 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  28.78 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  27.4 
 
 		 187 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  26.71 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  26.71 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1827  hypothetical protein  31.69 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  26.71 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  26.71 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  26.71 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  26.03 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  23.65 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  26.71 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  26.71 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  28.48 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  26.71 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  26.71 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  26.71 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  28.77 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  26.39 
 
 		 186 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  25.34 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  25.34 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  29.17 
 
 		 188 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  26.24 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  28.37 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3352  hypothetical protein  27.27 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0115365  decreased coverage  0.00224252 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  27.27 
 
 		 184 aa  60.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  26.17 
 
 		 197 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  30.22 
 
 		 190 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  26.81 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  26.76 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  27.21 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  28.19 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0426  hypothetical protein  23.31 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.152287  normal  0.709849 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  31.54 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  28.19 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  25.85 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  27.27 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  28.36 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  27.78 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  28.48 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  27.01 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  26.71 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  28.17 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  27.7 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  26.21 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  30.37 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  26.53 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  26.21 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  26.21 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  26.21 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  29.5 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  27.14 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  27.78 
 
 		 195 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  27.59 
 
 		 185 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  27.59 
 
 		 185 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  28.08 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  28.08 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  26.85 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  28.08 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  27.15 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  25.87 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  27.78 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  28.08 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  28.08 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  28.08 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  28.08 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  28.08 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88895  predicted protein  28.68 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0380911  hitchhiker  0.00603627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  28.08 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  27.27 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  26.71 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  27.27 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  26.57 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  26.14 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  26 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  27.97 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  25.17 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0413  hypothetical protein  28 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  26.53 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  27.69 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  27.4 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  25.81 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  27.4 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>