271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4765 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  100 
 
 		 281 aa  568  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  39.11 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  37.64 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  38.93 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  35.34 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  36.05 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  39.11 
 
 		 266 aa  171  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  36.5 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  36.74 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  36.27 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  36.8 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  39.29 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  33.58 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  30.34 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  30.88 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  31.2 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  28.19 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  27.73 
 
 		 247 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  29.73 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  30.39 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.11 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.11 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.11 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  36.49 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.11 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  35.14 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.11 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  37.8 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  33.11 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  31.91 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  33.11 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  33.11 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  33.11 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.11 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.11 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  33.11 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.11 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.11 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.23 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  31.91 
 
 		 391 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.43 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.46 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.43 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  32.62 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.43 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  32.26 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  32.24 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  34.06 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  36.6 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  33.78 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.35 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.62 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.35 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.35 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  34.95 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  31.08 
 
 		 378 aa  68.9  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  27.45 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  34.59 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  33.78 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  34.95 
 
 		 387 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  34.95 
 
 		 392 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  33.09 
 
 		 356 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  34.95 
 
 		 387 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  27.92 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  32.43 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  34.46 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  35.92 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  35.92 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  27.18 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  31.72 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  31.72 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  31.72 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  31.72 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.72 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.72 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  31.11 
 
 		 205 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.72 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.72 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  33.08 
 
 		 192 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  33.08 
 
 		 192 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  31.45 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0648  polysaccharide export periplasmic protein  29.87 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0639138  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  30 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  32.65 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  28.11 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  33.98 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  34.81 
 
 		 374 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  28.76 
 
 		 473 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 201 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  28.97 
 
 		 379 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 379 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3844  polysaccharide export periplasmic protein  24.43 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  37.62 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  30.71 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  27.92 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  28.57 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  28.08 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0647  polysaccharide export system, outer membrane component  28.86 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>