More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2921 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 475 aa  990    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.27 
 
 		 479 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  49.25 
 
 		 471 aa  498  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 473 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.72 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 472 aa  465  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0750  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.09 
 
 		 472 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.36 
 
 		 479 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  43.47 
 
 		 487 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 482 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  43.38 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  42.83 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 478 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 483 aa  388  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 475 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.38 
 
 		 470 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 473 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.76 
 
 		 480 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 532 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 477 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  41.9 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 469 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  42.61 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.33 
 
 		 492 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  41.25 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 504 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 470 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.92 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.63 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  40.99 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 477 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 473 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  41.81 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 474 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  40.81 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  41.03 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  40.81 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.15 
 
 		 487 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  40.69 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 477 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  40.6 
 
 		 474 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 481 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 475 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  40.51 
 
 		 477 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 475 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 474 aa  362  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  40.8 
 
 		 477 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 475 aa  362  8e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 474 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  40.81 
 
 		 474 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 477 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 477 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.6 
 
 		 474 aa  360  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.45 
 
 		 475 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 481 aa  360  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 489 aa  359  5e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.6 
 
 		 478 aa  358  9e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 473 aa  358  9e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.59 
 
 		 477 aa  355  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 		 474 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.15 
 
 		 472 aa  350  3e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 476 aa  350  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  38.03 
 
 		 473 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  38.61 
 
 		 474 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  39.45 
 
 		 473 aa  348  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 478 aa  348  9e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 		 479 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.81 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  38.43 
 
 		 473 aa  346  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  37.69 
 
 		 479 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 479 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0157  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 477 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00565529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>