More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2759 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  45.36 
 
 		 199 aa  184  6e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.5 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.59 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  43.22 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3669  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.47 
 
 		 241 aa  174  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  43.37 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4082  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.37 
 
 		 237 aa  164  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2139  DJ-1/PfpI family protein  38.69 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  35.81 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.34 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.18 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.67 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  32.99 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 349 aa  115  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 357 aa  113  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.39 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  33.16 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.84 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  31.47 
 
 		 336 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  31.41 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.67 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.24 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.23 
 
 		 228 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  33.68 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  32.8 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 322 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  35.33 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.93 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  32.64 
 
 		 362 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.94 
 
 		 193 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.19 
 
 		 231 aa  101  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 331 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 358 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 336 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  30.65 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  31.02 
 
 		 325 aa  99  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  34.18 
 
 		 334 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  33.16 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 331 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  31.41 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  32.97 
 
 		 329 aa  96.3  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  33.16 
 
 		 334 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  31.41 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 324 aa  95.9  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  30.53 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  31.89 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.94 
 
 		 338 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  31.63 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  33.87 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  33.86 
 
 		 316 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 322 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0354  ThiJ/PfpI  30.65 
 
 		 225 aa  93.2  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0471248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  31.16 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 311 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.03 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 341 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 311 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.03 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  27.32 
 
 		 194 aa  92.8  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  31.44 
 
 		 341 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.21 
 
 		 276 aa  92  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  31.41 
 
 		 317 aa  92  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  29.83 
 
 		 346 aa  92  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 312 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  29.8 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  33.33 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  33.33 
 
 		 691 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 321 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  31.63 
 
 		 197 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  33.33 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  33.33 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  33.33 
 
 		 232 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  33.33 
 
 		 232 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  33.33 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.88 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.85 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.96 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 310 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  32.98 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  33.88 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.53 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.88 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  36.13 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 338 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  33.84 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.29 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 315 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  31.96 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  30.46 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  35.36 
 
 		 320 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.26 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06760  conserved hypothetical protein  28.91 
 
 		 234 aa  88.2  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130038  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 334 aa  88.2  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 328 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  34.19 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.71 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>