83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2599 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  100 
 
 		 306 aa  641    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  54.42 
 
 		 306 aa  339  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  54.74 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  43.1 
 
 		 369 aa  231  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  43.42 
 
 		 357 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  42.55 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  41.84 
 
 		 361 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  39.45 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  38.3 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  38.02 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  37.13 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  37.61 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  36.33 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  39.17 
 
 		 721 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  39.17 
 
 		 694 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  39.17 
 
 		 721 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  37.25 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  35.36 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  34.34 
 
 		 352 aa  152  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  35.74 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.43 
 
 		 689 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  38.25 
 
 		 773 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  38.99 
 
 		 698 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.79 
 
 		 699 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.65 
 
 		 726 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  34.18 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  33.6 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  34.75 
 
 		 669 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  35.02 
 
 		 708 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  38.46 
 
 		 675 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  35.32 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  35.32 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  37.79 
 
 		 728 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  34.93 
 
 		 313 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  36.48 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  38.21 
 
 		 675 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  34.05 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  37.79 
 
 		 691 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  32.18 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  36.87 
 
 		 712 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  31.95 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  32.05 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  31.9 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  31.89 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  31.58 
 
 		 352 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  33.19 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 353 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  37.61 
 
 		 337 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  32.09 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  33.47 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  31.02 
 
 		 407 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  28.12 
 
 		 372 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  29.1 
 
 		 347 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  30.34 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  32.93 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  31.6 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  47.97 
 
 		 125 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  32.46 
 
 		 671 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  30.65 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  30.65 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  30.65 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  27.41 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  29.39 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  36.43 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  34.04 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  47.89 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  29.46 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  27.59 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  35.21 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  27.38 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  27.38 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  34.12 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  27.68 
 
 		 388 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  31.76 
 
 		 421 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>