More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1027 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 344 aa  700    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  58.36 
 
 		 350 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  56.18 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  55.72 
 
 		 348 aa  401  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  56.05 
 
 		 352 aa  402  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  53.2 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  52.51 
 
 		 346 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  51.34 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  52.21 
 
 		 339 aa  359  3e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  48.66 
 
 		 339 aa  349  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  43.52 
 
 		 358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  42.29 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  42.15 
 
 		 369 aa  264  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  42.81 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  41.14 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  41.8 
 
 		 354 aa  249  6e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  42.5 
 
 		 355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  43.87 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  36.76 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  36.84 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  34.9 
 
 		 329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  36.23 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  37.39 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  39.8 
 
 		 333 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  34.48 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  33.82 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  35.21 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  38.41 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  34.4 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  32.08 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  32.66 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  33.14 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  34.11 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  34.59 
 
 		 318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  34.59 
 
 		 318 aa  162  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.02 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  32.34 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  34.38 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  31.3 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 		 336 aa  156  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  38.06 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  34.01 
 
 		 329 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  31.83 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 		 306 aa  155  9e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  35.94 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  35.4 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  30.84 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  30.09 
 
 		 318 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  36.03 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  34.24 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2567  thiamine monophosphate kinase  34.46 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  36.91 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  35.89 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  37.35 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  32.14 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  36.15 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  31.36 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  37.63 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  36.81 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  36.81 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  35.12 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  32.7 
 
 		 320 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  33.82 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  30.09 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  29.9 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  35.59 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  35.59 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  33.22 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  35.59 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  35.59 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  29.11 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  37.15 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  33.68 
 
 		 333 aa  143  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  32.85 
 
 		 329 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  32.85 
 
 		 329 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  35.1 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  29.75 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  32.85 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  31.6 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  30.48 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  35.47 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  35.58 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  31.38 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  31.7 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  33.04 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  31.58 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  30.88 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  33.54 
 
 		 361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  33.92 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  33.92 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  33.92 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  33.92 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  33.92 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  33.92 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  33.13 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  33.92 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>