More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0883 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 275 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  58.24 
 
 		 279 aa  310  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  51.82 
 
 		 277 aa  277  2e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  52.35 
 
 		 277 aa  271  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  49.28 
 
 		 278 aa  257  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  50.36 
 
 		 278 aa  255  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  43.03 
 
 		 320 aa  235  7e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  43.91 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  45.45 
 
 		 276 aa  228  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04070  elongation factor Ts  42.9 
 
 		 321 aa  223  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1609  translation elongation factor Ts  40.12 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00132099  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.01 
 
 		 288 aa  219  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  41.26 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  40.36 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  40.91 
 
 		 288 aa  209  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  43.62 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  44.1 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  43.66 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  41.09 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  43.26 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 273 aa  205  5e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  42.12 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  42.71 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  44.36 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  41.81 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  42.09 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  39.16 
 
 		 288 aa  200  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  42.36 
 
 		 307 aa  198  9e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  39.51 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  41.87 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  43.88 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  38.81 
 
 		 288 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  41.64 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  41.09 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  41.18 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 307 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  41.33 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  41.87 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  40.36 
 
 		 293 aa  191  9e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  40.15 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  41.7 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  43.12 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  39.42 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  39.56 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  40.51 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  40.62 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.52 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  42.86 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  41.94 
 
 		 278 aa  188  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  40 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  40.73 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  39.39 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  40.86 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  42.07 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  42.07 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  38.7 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  42.86 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  42.07 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  40.66 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  41.09 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  39.05 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  39.05 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  39.3 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 291 aa  185  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  38.01 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  41.18 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  38.33 
 
 		 286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  39.56 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  42.49 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  39.13 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  39.64 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  40.83 
 
 		 308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  40.23 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  40.42 
 
 		 310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  39.52 
 
 		 312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  39.85 
 
 		 293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  38.15 
 
 		 294 aa  182  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  39.39 
 
 		 293 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  40.14 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  39.05 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  39.05 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  39.05 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  39.05 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  39.05 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>