More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0394 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  100 
 
 		 610 aa  1239    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  48.26 
 
 		 612 aa  588  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  48.53 
 
 		 613 aa  584  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  46.61 
 
 		 613 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0351  hypothetical protein  46.32 
 
 		 611 aa  554  1e-156  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.378963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  45.02 
 
 		 608 aa  535  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  44.01 
 
 		 607 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  44.61 
 
 		 616 aa  512  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  42.48 
 
 		 609 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 566 aa  488  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  36.57 
 
 		 571 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  35.98 
 
 		 639 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  36.24 
 
 		 571 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  35.32 
 
 		 647 aa  388  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  40.08 
 
 		 582 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  40.88 
 
 		 556 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  36.33 
 
 		 634 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  38.84 
 
 		 632 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  35.9 
 
 		 611 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.62 
 
 		 577 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  35.9 
 
 		 649 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0382  ABC transporter related  39.66 
 
 		 641 aa  372  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.588151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.6 
 
 		 575 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.04 
 
 		 572 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  34.79 
 
 		 611 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  34.47 
 
 		 611 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  39.46 
 
 		 589 aa  363  4e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.63 
 
 		 611 aa  361  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.49 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.45 
 
 		 578 aa  357  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0272  ABC transporter related  35.34 
 
 		 634 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  39.18 
 
 		 579 aa  356  8.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  38.08 
 
 		 618 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  37.12 
 
 		 578 aa  354  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  37.12 
 
 		 578 aa  354  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.93 
 
 		 583 aa  350  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.5 
 
 		 602 aa  350  6e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.9 
 
 		 582 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  36.68 
 
 		 584 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  40.82 
 
 		 601 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  38.6 
 
 		 598 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  38.9 
 
 		 582 aa  347  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.9 
 
 		 582 aa  347  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  38.9 
 
 		 582 aa  347  4e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.9 
 
 		 582 aa  347  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.03 
 
 		 613 aa  347  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.9 
 
 		 582 aa  347  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.9 
 
 		 582 aa  347  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.9 
 
 		 582 aa  347  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.9 
 
 		 582 aa  347  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.9 
 
 		 582 aa  347  4e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.16 
 
 		 582 aa  347  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.16 
 
 		 582 aa  347  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.16 
 
 		 582 aa  347  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.16 
 
 		 582 aa  347  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.16 
 
 		 586 aa  347  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.16 
 
 		 582 aa  347  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1770  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.58 
 
 		 607 aa  346  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0549134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.16 
 
 		 586 aa  346  7e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.97 
 
 		 586 aa  346  7e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.97 
 
 		 586 aa  346  7e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2826  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  37.36 
 
 		 604 aa  345  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.070781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  34.69 
 
 		 603 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  36.78 
 
 		 586 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.5 
 
 		 586 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.78 
 
 		 586 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  34.85 
 
 		 603 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.1 
 
 		 596 aa  343  4e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.31 
 
 		 586 aa  343  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.59 
 
 		 585 aa  343  5e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.53 
 
 		 583 aa  342  9e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.95 
 
 		 580 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.64 
 
 		 597 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.12 
 
 		 586 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.27 
 
 		 600 aa  341  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.99 
 
 		 582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.99 
 
 		 582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  38.57 
 
 		 578 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.99 
 
 		 582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.91 
 
 		 592 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.52 
 
 		 582 aa  340  4e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.33 
 
 		 580 aa  340  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  35.59 
 
 		 586 aa  340  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.13 
 
 		 582 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.48 
 
 		 582 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.83 
 
 		 582 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  38.73 
 
 		 579 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2199  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.96 
 
 		 600 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.38 
 
 		 582 aa  337  2.9999999999999997e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1638  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.31 
 
 		 604 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  36.38 
 
 		 588 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  38.33 
 
 		 584 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 578 aa  337  5e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39 
 
 		 583 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  38.2 
 
 		 575 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.85 
 
 		 588 aa  335  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  34.92 
 
 		 586 aa  335  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.5 
 
 		 600 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.53 
 
 		 581 aa  335  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.66 
 
 		 588 aa  334  3e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>