56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1308 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  100 
 
 		 1085 aa  2209    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  44.32 
 
 		 1418 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  34.94 
 
 		 981 aa  271  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  33.15 
 
 		 1213 aa  245  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.93 
 
 		 1410 aa  238  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  31.57 
 
 		 1200 aa  228  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  47.35 
 
 		 1091 aa  209  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  29.05 
 
 		 1000 aa  191  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.04 
 
 		 1212 aa  189  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.52 
 
 		 584 aa  184  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  31.47 
 
 		 857 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  28.44 
 
 		 671 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.18 
 
 		 1448 aa  174  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  28 
 
 		 675 aa  168  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.67 
 
 		 823 aa  165  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.73 
 
 		 933 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.72 
 
 		 1109 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1010  APHP domain protein  46.61 
 
 		 300 aa  108  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  30.74 
 
 		 797 aa  99.8  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  28.03 
 
 		 926 aa  63.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3628  hypothetical protein  25.93 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.61 
 
 		 6885 aa  58.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4103  hypothetical protein  25.93 
 
 		 424 aa  57.4  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  26.52 
 
 		 631 aa  55.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.52 
 
 		 953 aa  53.9  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000882401  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4400  hypothetical protein  24.34 
 
 		 423 aa  54.3  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0913462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2293  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.06 
 
 		 372 aa  51.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1915  hypothetical protein  27.08 
 
 		 606 aa  51.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  48.08 
 
 		 1281 aa  51.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2086  hypothetical protein  26.18 
 
 		 355 aa  50.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  56.82 
 
 		 202 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1320  putative lipoprotein  25.52 
 
 		 420 aa  50.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1311  putative lipoprotein  25.52 
 
 		 420 aa  49.3  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1813  hypothetical protein  25.73 
 
 		 429 aa  49.3  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0716  putative lipoprotein  25.52 
 
 		 421 aa  48.9  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1476  hypothetical protein  30.77 
 
 		 322 aa  48.9  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  44.74 
 
 		 1409 aa  48.9  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1457  putative lipoprotein  24.19 
 
 		 419 aa  48.9  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.47 
 
 		 372 aa  49.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0434  putative lipoprotein  25.52 
 
 		 421 aa  48.9  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1151  putative lipoprotein  25.52 
 
 		 421 aa  48.9  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1808  putative lipoprotein  25.52 
 
 		 420 aa  48.5  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00934071  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  49.09 
 
 		 203 aa  48.5  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 201 aa  48.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  28.57 
 
 		 807 aa  48.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.93 
 
 		 1454 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  37.19 
 
 		 771 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3592  hypothetical protein  26.85 
 
 		 528 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237633  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4973  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.23 
 
 		 652 aa  47  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4285  hypothetical protein  42.62 
 
 		 557 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0697  hypothetical protein  43.33 
 
 		 564 aa  46.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000189598  hitchhiker  0.0000524761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1477  hypothetical protein  28.31 
 
 		 351 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  26.39 
 
 		 2030 aa  46.2  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  52.27 
 
 		 259 aa  45.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0795  hypothetical protein  22.45 
 
 		 456 aa  45.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.58 
 
 		 1265 aa  44.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>