18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1477 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1477  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  717    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1476  hypothetical protein  77.78 
 
 
322 aa  543  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199967  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3724  hypothetical protein  28.91 
 
 
424 aa  86.3  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0253  hypothetical protein  28.13 
 
 
298 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1126  hypothetical protein  27.59 
 
 
657 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1125  hypothetical protein  27.2 
 
 
657 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.837381  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2019  hypothetical protein  24.76 
 
 
498 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.387729  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1127  hypothetical protein  24.1 
 
 
489 aa  69.7  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.582071  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1699  hypothetical protein  28.87 
 
 
489 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.72795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1107  hypothetical protein  26.1 
 
 
695 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1487  hypothetical protein  29.92 
 
 
764 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330928  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2873  hypothetical protein  27.41 
 
 
493 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238418  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1105  hypothetical protein  26.58 
 
 
537 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1124  hypothetical protein  24.19 
 
 
868 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2640  hypothetical protein  23.73 
 
 
497 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.310714  normal  0.0812139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  25.3 
 
 
747 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1529  hypothetical protein  47.92 
 
 
290 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.352197  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  28.31 
 
 
1085 aa  47  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
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