40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1813 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1813  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  846    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679097  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4103  hypothetical protein  73.96 
 
 
424 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3628  hypothetical protein  73.96 
 
 
424 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174026  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4400  hypothetical protein  65.88 
 
 
423 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0913462  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0792  hypothetical protein  55.61 
 
 
431 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.992362  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1457  putative lipoprotein  58.99 
 
 
419 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  54.67 
 
 
372 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1320  putative lipoprotein  58.53 
 
 
420 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2293  parallel beta-helix repeat-containing protein  61.27 
 
 
372 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1311  putative lipoprotein  58.47 
 
 
420 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0434  putative lipoprotein  58.82 
 
 
421 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0716  putative lipoprotein  58.82 
 
 
421 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1151  putative lipoprotein  58.82 
 
 
421 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1808  putative lipoprotein  58.82 
 
 
420 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00934071  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3715  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.56 
 
 
563 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1348  hypothetical protein  36.19 
 
 
364 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1329  hypothetical protein  36.36 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1312  hypothetical protein  36.36 
 
 
359 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  27.64 
 
 
807 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  27.35 
 
 
671 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  22.13 
 
 
1410 aa  61.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  25.46 
 
 
1085 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  26.01 
 
 
675 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1082  putative lipoprotein  31.53 
 
 
145 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.81 
 
 
1448 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  30 
 
 
1109 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  30.4 
 
 
1213 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  30.4 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  25.34 
 
 
1200 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  22.02 
 
 
409 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3654  hypothetical protein  27.69 
 
 
791 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3581  hypothetical protein  27.69 
 
 
791 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  26.11 
 
 
445 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  27.12 
 
 
483 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  29.49 
 
 
1000 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3586  hypothetical protein  27.27 
 
 
784 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  22.81 
 
 
1418 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1718  hypothetical protein  31.14 
 
 
508 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.586514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.69 
 
 
1212 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.07 
 
 
510 aa  43.1  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>