More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1024 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1024  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 237 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  38.57 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  35.68 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1467  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0237528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  35.37 
 
 		 233 aa  158  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  35.81 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  35.81 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  35.81 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  35.37 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  35.37 
 
 		 233 aa  157  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  35.37 
 
 		 233 aa  157  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 242 aa  157  8e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  35.37 
 
 		 233 aa  157  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  35.37 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  34.8 
 
 		 234 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  36.16 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  34.5 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3872  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0547348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  35.11 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  34.5 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  33.63 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  33.93 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 240 aa  149  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.81 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  34.93 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 234 aa  148  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.59 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 229 aa  147  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  35.71 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.16 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.08 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4168  DNA-binding response regulator  37.17 
 
 		 234 aa  145  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2015  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  35.53 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  34.98 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  34.98 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.53 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1173  DNA-binding response regulator  36.73 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.423617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0844  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  34.53 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  34.53 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  33.63 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  35.24 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  35.24 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  34.21 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  34.08 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  35.24 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  35.24 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  35.24 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  35.24 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  35.24 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  34.08 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.16 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  35.24 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  35.24 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  34.21 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  32.42 
 
 		 247 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3292  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  32.58 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  32.88 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>