More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2189 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2189  trigger factor  100 
 
 		 427 aa  867    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.981322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1954  trigger factor  71.29 
 
 		 428 aa  624  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.657393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2137  trigger factor  64.07 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2564  trigger factor domain  61.79 
 
 		 426 aa  532  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2292  trigger factor  62.06 
 
 		 427 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0272  trigger factor  56.91 
 
 		 436 aa  510  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.576701 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0238  trigger factor  54.21 
 
 		 440 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2406  trigger factor  33.8 
 
 		 450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  26.24 
 
 		 436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  24.94 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  25.93 
 
 		 435 aa  126  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  26.55 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  25.97 
 
 		 437 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  23.94 
 
 		 448 aa  124  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  25.96 
 
 		 433 aa  124  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  25.46 
 
 		 439 aa  123  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  28.02 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  24.57 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  25.97 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  27.08 
 
 		 479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  23.42 
 
 		 432 aa  120  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  25.37 
 
 		 433 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  24.72 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  24.94 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  24.89 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  24.89 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  24.48 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  25.13 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  27.97 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  24.89 
 
 		 429 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  24.43 
 
 		 443 aa  117  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  25.46 
 
 		 436 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  27.94 
 
 		 449 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  27.84 
 
 		 441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  24 
 
 		 445 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  24.53 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  23.83 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  24.74 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  24 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  25.24 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  23.2 
 
 		 434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  24 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  24.28 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  24.14 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  26.03 
 
 		 440 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  25.26 
 
 		 461 aa  113  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  24.54 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  25.52 
 
 		 473 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  24.21 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  26.55 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  23.73 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  23.73 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  23.58 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  23.58 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  25.67 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  23.58 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  23.53 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  23.58 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  23.58 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  23.58 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  23.58 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  23.58 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  23.58 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  28.12 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  23.82 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  25.19 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  23.58 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  23.58 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  22.43 
 
 		 434 aa  110  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  24.7 
 
 		 434 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  24.71 
 
 		 433 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  23.73 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  24.22 
 
 		 435 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  23.32 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  23.32 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  23.32 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  23.75 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  23.06 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  27.84 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  23.06 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  23.06 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  23.2 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  25.56 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  29.26 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  26.45 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  23.2 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1710  trigger factor  23.71 
 
 		 449 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  0.0467647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  23.2 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  23.2 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  25.86 
 
 		 429 aa  107  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  25.45 
 
 		 442 aa  107  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  25 
 
 		 434 aa  106  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  22.28 
 
 		 432 aa  106  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  24.29 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  29.8 
 
 		 446 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  26.27 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  24.2 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1886  trigger factor  23.74 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  27.2 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  28.03 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>