More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1798 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  100 
 
 
301 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  66.45 
 
 
302 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  62 
 
 
290 aa  382  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  63.67 
 
 
302 aa  376  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  59.53 
 
 
309 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  57.58 
 
 
302 aa  364  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  57.48 
 
 
302 aa  362  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  58.53 
 
 
309 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  55.37 
 
 
300 aa  358  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  53.07 
 
 
312 aa  328  8e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  52.51 
 
 
303 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  52.67 
 
 
296 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  51.52 
 
 
285 aa  318  6e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  52.84 
 
 
303 aa  315  7e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  52.68 
 
 
301 aa  311  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  51.52 
 
 
303 aa  301  6.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  50.67 
 
 
303 aa  301  7.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  52.33 
 
 
303 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  50.34 
 
 
283 aa  299  3e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  49.16 
 
 
282 aa  291  9e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  45.45 
 
 
289 aa  262  4.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  44.33 
 
 
298 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  43.67 
 
 
298 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  44.69 
 
 
306 aa  257  1e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  42.67 
 
 
298 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  44.78 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  44.63 
 
 
286 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  42.03 
 
 
287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  44.3 
 
 
286 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  44.44 
 
 
286 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  44.11 
 
 
279 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  41.28 
 
 
283 aa  246  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  41.53 
 
 
284 aa  242  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.87 
 
 
310 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.32 
 
 
304 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  39 
 
 
284 aa  235  8e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  40.8 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  40.88 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  43.83 
 
 
292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  37.46 
 
 
294 aa  232  7.000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  39.33 
 
 
280 aa  231  9e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  44.52 
 
 
299 aa  231  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  38.21 
 
 
307 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  42.47 
 
 
283 aa  229  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  39.27 
 
 
285 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  39.53 
 
 
290 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  39.53 
 
 
290 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  38.91 
 
 
285 aa  226  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  39.6 
 
 
285 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  42.47 
 
 
278 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  40 
 
 
284 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  39.67 
 
 
274 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.67 
 
 
284 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  41.48 
 
 
298 aa  223  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  40.26 
 
 
284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  39.26 
 
 
277 aa  222  7e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  41.12 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  39.67 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  37.21 
 
 
294 aa  218  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  38.59 
 
 
285 aa  217  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  36.79 
 
 
293 aa  215  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  39.67 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  40.27 
 
 
279 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  37.17 
 
 
289 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  34.9 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  39.02 
 
 
290 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  37.05 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  37.05 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  37.05 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  37.05 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  36.72 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  37.7 
 
 
292 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  37.05 
 
 
290 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  37.05 
 
 
290 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  37.05 
 
 
290 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  37.5 
 
 
310 aa  194  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  36.39 
 
 
290 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  37.05 
 
 
290 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  36.72 
 
 
290 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  36.39 
 
 
337 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  37.05 
 
 
290 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  37.05 
 
 
290 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  34.56 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  35.97 
 
 
282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  36.08 
 
 
283 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  36.07 
 
 
318 aa  186  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  34.75 
 
 
282 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  37.05 
 
 
292 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  35.35 
 
 
286 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01780  conserved hypothetical protein  37.79 
 
 
337 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293563  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  34.32 
 
 
282 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  38.33 
 
 
337 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  37.29 
 
 
286 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  31.77 
 
 
288 aa  179  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  34.82 
 
 
315 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  35.99 
 
 
346 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  35.16 
 
 
328 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  34.34 
 
 
282 aa  176  6e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  33.33 
 
 
295 aa  176  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  36.04 
 
 
320 aa  175  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>