227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0412 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0412  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 127 aa  260  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0379  aspartate alpha-decarboxylase  88.98 
 
 		 129 aa  237  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0867961 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1450  aspartate alpha-decarboxylase  82.68 
 
 		 129 aa  220  4.9999999999999996e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1769  aspartate alpha-decarboxylase  80.31 
 
 		 128 aa  212  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.25333 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0310  aspartate alpha-decarboxylase  80.31 
 
 		 128 aa  211  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0408  aspartate alpha-decarboxylase  77.17 
 
 		 128 aa  207  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.293009  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0379  aspartate alpha-decarboxylase  77.17 
 
 		 131 aa  204  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.172281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  55.36 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  53.64 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  53.04 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  53.57 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  53.57 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  55.75 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  51.79 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  50.86 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  51.79 
 
 		 121 aa  120  9e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  52.63 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  52.21 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  53.98 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0774  aspartate 1-decarboxylase  52.21 
 
 		 125 aa  117  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  50.91 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4555  aspartate 1-decarboxylase  54.55 
 
 		 116 aa  117  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687644  normal  0.429521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0750  aspartate 1-decarboxylase  45.69 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  53.45 
 
 		 128 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  54.87 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1828  aspartate alpha-decarboxylase  46.83 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.683514  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  49.07 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0826  aspartate alpha-decarboxylase  52.21 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  52.78 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  51.3 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  49.07 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  47.22 
 
 		 142 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  46.49 
 
 		 131 aa  113  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  47.58 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3547  aspartate alpha-decarboxylase  48.25 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  52.68 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  46.79 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  49.07 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  46.3 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  49.58 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  45.9 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0802  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000217258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  47.79 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  45.45 
 
 		 135 aa  110  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  48.21 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  48.33 
 
 		 134 aa  110  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  47.79 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  47.79 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  49.07 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3834  aspartate alpha-decarboxylase  49.11 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0726  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00148061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  44.55 
 
 		 135 aa  110  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3464  aspartate 1-decarboxylase  53.57 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  46.77 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  45.45 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2996  aspartate alpha-decarboxylase  49.55 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  47.22 
 
 		 127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  44.44 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  47.79 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  45.69 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  47.22 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  47.22 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  50.86 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  51.35 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  48.15 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  42.24 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2856  aspartate alpha-decarboxylase  49.55 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 128 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  48.36 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 128 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2123  aspartate alpha-decarboxylase  50.89 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.244541  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 128 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  46.55 
 
 		 126 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  45.22 
 
 		 135 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  45.22 
 
 		 135 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  46.3 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>