102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2136 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2136  beta-lactamase superfamily hydrolase  100 
 
 		 532 aa  1125    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  39.58 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  28.02 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  23.69 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  24.72 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  35.94 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  31.31 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  31.31 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  31.43 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  31.31 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  31.31 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  31.31 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  31.31 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  31.31 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  31.31 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  31.31 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  24.23 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  30.48 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  30.48 
 
 		 314 aa  57  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  31.68 
 
 		 322 aa  57  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  29.41 
 
 		 305 aa  56.6  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  23.63 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  23.63 
 
 		 341 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  29.75 
 
 		 315 aa  55.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  25.52 
 
 		 305 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  25.52 
 
 		 305 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  25.52 
 
 		 305 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  35 
 
 		 301 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  26.95 
 
 		 305 aa  54.7  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  36.67 
 
 		 304 aa  54.3  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  35.48 
 
 		 313 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  40.68 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  40.68 
 
 		 307 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  40.68 
 
 		 307 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  40.68 
 
 		 307 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  40.68 
 
 		 307 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  40.68 
 
 		 307 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  40.68 
 
 		 307 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  40.68 
 
 		 307 aa  52  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  40.68 
 
 		 307 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  40.68 
 
 		 307 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  25.31 
 
 		 393 aa  51.6  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  38.33 
 
 		 304 aa  50.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 		 247 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  36.67 
 
 		 326 aa  50.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  35.59 
 
 		 301 aa  50.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  23.11 
 
 		 308 aa  50.4  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 		 243 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  37.35 
 
 		 259 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 		 302 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2672  beta-lactamase domain protein  37.1 
 
 		 320 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  33.33 
 
 		 314 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  26.67 
 
 		 345 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.33 
 
 		 314 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  38.98 
 
 		 307 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  27.72 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.45 
 
 		 312 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  31.67 
 
 		 304 aa  48.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  27.72 
 
 		 312 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  28.57 
 
 		 283 aa  47.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  23.02 
 
 		 393 aa  47.4  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.45 
 
 		 312 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  30.65 
 
 		 305 aa  47.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  23.94 
 
 		 312 aa  47  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  27.72 
 
 		 320 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  23.61 
 
 		 309 aa  47  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.47 
 
 		 312 aa  47  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 		 243 aa  47  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  26.73 
 
 		 314 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  26.73 
 
 		 314 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  26.73 
 
 		 321 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  24.75 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 		 321 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  30.77 
 
 		 319 aa  46.6  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  33.9 
 
 		 308 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  30.3 
 
 		 251 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  25.49 
 
 		 319 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  29.21 
 
 		 414 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  35.48 
 
 		 309 aa  45.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  33.85 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  35.48 
 
 		 285 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 243 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 243 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 		 319 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  35.59 
 
 		 307 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  28.57 
 
 		 320 aa  45.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  27.72 
 
 		 305 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 251 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  26.47 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 337 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  31.67 
 
 		 303 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  25.21 
 
 		 331 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  30.12 
 
 		 381 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.51 
 
 		 327 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  27.45 
 
 		 306 aa  44.3  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  26.67 
 
 		 334 aa  44.3  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  27.35 
 
 		 306 aa  43.9  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  27.72 
 
 		 313 aa  43.5  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  31.82 
 
 		 300 aa  43.5  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>