54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1837 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  100 
 
 		 909 aa  1860    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  39.08 
 
 		 911 aa  635  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  37.7 
 
 		 919 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  28.04 
 
 		 1039 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  28.45 
 
 		 968 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  26.22 
 
 		 969 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  26.22 
 
 		 969 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  26.11 
 
 		 960 aa  257  6e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  26.07 
 
 		 951 aa  252  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1000 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  23.3 
 
 		 997 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  22.74 
 
 		 984 aa  171  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1100 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  24.93 
 
 		 780 aa  84  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  23.89 
 
 		 781 aa  74.7  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1018 aa  68.2  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.24 
 
 		 957 aa  65.9  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  25 
 
 		 794 aa  64.3  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1016 aa  63.9  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  21.81 
 
 		 896 aa  64.3  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  20.83 
 
 		 786 aa  62.8  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  21.37 
 
 		 1001 aa  61.6  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.47 
 
 		 994 aa  57.8  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1049 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  26.72 
 
 		 788 aa  55.8  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  22.63 
 
 		 999 aa  56.2  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  20.42 
 
 		 1043 aa  55.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  23.4 
 
 		 783 aa  55.5  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  26.44 
 
 		 788 aa  55.5  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  25.72 
 
 		 788 aa  55.8  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  21.21 
 
 		 1000 aa  55.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  22.06 
 
 		 781 aa  54.7  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.84 
 
 		 1048 aa  52.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  21.81 
 
 		 991 aa  52.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  21.32 
 
 		 803 aa  52.4  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  24.12 
 
 		 914 aa  51.6  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  20.09 
 
 		 1015 aa  51.2  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.54 
 
 		 1049 aa  50.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1042 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  20.06 
 
 		 1049 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  23.32 
 
 		 911 aa  49.3  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  20.04 
 
 		 922 aa  48.9  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  20.04 
 
 		 1054 aa  48.5  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  27.4 
 
 		 865 aa  48.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  21.92 
 
 		 858 aa  48.1  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  18.77 
 
 		 1014 aa  46.6  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  22.28 
 
 		 994 aa  46.6  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  21.6 
 
 		 988 aa  47  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  21.67 
 
 		 858 aa  46.2  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  22.55 
 
 		 302 aa  46.2  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0086  hypothetical protein  25 
 
 		 945 aa  46.2  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  28.16 
 
 		 297 aa  45.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  20.78 
 
 		 1040 aa  44.3  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3229  hypothetical protein  24.87 
 
 		 862 aa  44.3  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>