218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1469 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  100 
 
 		 527 aa  1099    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0843  glycosy hydrolase family protein  44.88 
 
 		 502 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00330381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1712  glycoside hydrolase family 31  40.53 
 
 		 533 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000051017  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1770  glycoside hydrolase family 31  39.31 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.134766  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  35.1 
 
 		 430 aa  253  5.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0259  glycoside hydrolase family 31  33.74 
 
 		 631 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0820064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4334  glycoside hydrolase family protein  32.53 
 
 		 616 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38421  predicted protein  32.88 
 
 		 559 aa  197  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452022  hitchhiker  0.000596343 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  27.09 
 
 		 752 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  26.84 
 
 		 765 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  28.74 
 
 		 760 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  25.35 
 
 		 757 aa  131  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  25.85 
 
 		 779 aa  130  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  25.4 
 
 		 772 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  27.12 
 
 		 765 aa  127  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  26.11 
 
 		 712 aa  125  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  25.38 
 
 		 681 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  24.59 
 
 		 772 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  24.59 
 
 		 772 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  25.25 
 
 		 772 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  24.59 
 
 		 772 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  28.68 
 
 		 764 aa  123  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  27.57 
 
 		 775 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  28.1 
 
 		 764 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  27.43 
 
 		 772 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  24.08 
 
 		 774 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  24.85 
 
 		 760 aa  120  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  24.95 
 
 		 772 aa  120  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  24.95 
 
 		 772 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  24.74 
 
 		 772 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  24.95 
 
 		 772 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  24.74 
 
 		 772 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  26.88 
 
 		 770 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  24.54 
 
 		 772 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  24.74 
 
 		 772 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  24.59 
 
 		 772 aa  118  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  25.64 
 
 		 771 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  25.92 
 
 		 749 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  24.33 
 
 		 772 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  24.91 
 
 		 780 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  24.13 
 
 		 775 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  23.81 
 
 		 763 aa  113  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  25.05 
 
 		 766 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  27.43 
 
 		 679 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  27.67 
 
 		 801 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  25.82 
 
 		 661 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  26.34 
 
 		 828 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  25.52 
 
 		 699 aa  110  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  25.7 
 
 		 792 aa  110  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  22.95 
 
 		 743 aa  109  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  25.15 
 
 		 780 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  26.51 
 
 		 804 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  23.69 
 
 		 760 aa  107  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 		 799 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  27.32 
 
 		 752 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  24.94 
 
 		 794 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 		 695 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  23.68 
 
 		 777 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  25.39 
 
 		 668 aa  105  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  26 
 
 		 770 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  22.82 
 
 		 779 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  26.05 
 
 		 1024 aa  103  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  26.21 
 
 		 679 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  26.44 
 
 		 679 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  26.44 
 
 		 679 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  26.21 
 
 		 679 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  26.21 
 
 		 679 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  22.28 
 
 		 778 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  24.57 
 
 		 768 aa  100  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  25.9 
 
 		 690 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  25.48 
 
 		 779 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  24.49 
 
 		 815 aa  99  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  24.88 
 
 		 836 aa  98.6  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 		 944 aa  98.6  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  24.74 
 
 		 775 aa  97.8  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 		 784 aa  97.4  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  24.46 
 
 		 783 aa  96.7  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  24.94 
 
 		 785 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  24.36 
 
 		 823 aa  95.5  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  25 
 
 		 795 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  26.01 
 
 		 836 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  24.72 
 
 		 777 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  25.27 
 
 		 763 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  25.56 
 
 		 803 aa  95.1  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  24.28 
 
 		 779 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4108  glycoside hydrolase family 31  23.99 
 
 		 678 aa  94  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4401  alpha-glucosidase  23.99 
 
 		 678 aa  94  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4263  alpha-glucosidase  24.46 
 
 		 678 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  25.5 
 
 		 695 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2697  glycoside hydrolase family 31  25.99 
 
 		 715 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246264  normal  0.17136 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03763  alpha-glucosidase  23.72 
 
 		 667 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  24.69 
 
 		 840 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03712  hypothetical protein  23.72 
 
 		 654 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5324  alpha-glucosidase  24.19 
 
 		 678 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  23.49 
 
 		 806 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  25.3 
 
 		 825 aa  90.9  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  24.52 
 
 		 755 aa  90.1  9e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4407  alpha-glucosidase  23.59 
 
 		 678 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4341  alpha-glucosidase  23.12 
 
 		 678 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  25.12 
 
 		 806 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>