38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1017 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1017  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 261 aa  546  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0209  glycoside hydrolase family protein  29.52 
 
 		 246 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  30.57 
 
 		 883 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  26.03 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  30.73 
 
 		 1321 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  25.27 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0445  glycoside hydrolase family 16  25.5 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0110931  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  27.97 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.85 
 
 		 633 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9256  hypothetical protein  22.12 
 
 		 380 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3331  hypothetical protein  31.93 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.214123  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  24.35 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  25.7 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  25.9 
 
 		 556 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.89 
 
 		 912 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  27.42 
 
 		 1332 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 752 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  22.7 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  26.29 
 
 		 409 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  27.53 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1972  glycoside hydrolase family protein  30.46 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  23.46 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  25.39 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  23.29 
 
 		 328 aa  46.2  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1209  licheninase  28.96 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0812437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2550  endo-beta-1,3-1,4-glycanase protein  28.96 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.42 
 
 		 819 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.58 
 
 		 627 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.36 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  29.63 
 
 		 389 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2952  glycoside hydrolase family 16  23.96 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123961  hitchhiker  0.0028074 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5929  endo-1,3-1,4-beta-glycanase  24.83 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  28.8 
 
 		 383 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  24.91 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  21.03 
 
 		 427 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  31.93 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>