26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0209 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0209  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
246 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9256  hypothetical protein  37.39 
 
 
380 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3331  hypothetical protein  30.91 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.214123  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1017  glycoside hydrolase family 16  29.52 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0445  glycoside hydrolase family 16  25.37 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0110931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4636  hypothetical protein  23.18 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  25.91 
 
 
389 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 
320 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.11 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  25 
 
 
883 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  25.85 
 
 
475 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  32.94 
 
 
319 aa  46.2  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.27 
 
 
1694 aa  45.4  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 
686 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  21.88 
 
 
547 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  30.85 
 
 
1332 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  25.79 
 
 
752 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  25.88 
 
 
383 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  28.23 
 
 
608 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5929  endo-1,3-1,4-beta-glycanase  25.14 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  26.6 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 
1321 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  26.72 
 
 
1028 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  34.41 
 
 
469 aa  42.4  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  25.54 
 
 
409 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 
291 aa  42  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>