119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0452 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0452  surface antigen (D15)  100 
 
 		 858 aa  1751    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.150297  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12263  hypothetical protein  40.36 
 
 		 853 aa  633  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.167756  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1464  surface antigen (D15)  41.24 
 
 		 851 aa  633  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1674  surface antigen (D15)  23.39 
 
 		 810 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1223  outer membrane protein  25.14 
 
 		 766 aa  221  5e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.760862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3472  surface antigen (D15)  25.79 
 
 		 774 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.151472 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03805  hypothetical protein  25.31 
 
 		 762 aa  217  9e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0980  hypothetical protein  24.97 
 
 		 745 aa  207  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0992  surface antigen (D15)  24.73 
 
 		 875 aa  201  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2726  surface antigen (D15)  24.38 
 
 		 806 aa  194  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1900  surface antigen (D15)  24.38 
 
 		 772 aa  194  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1269  surface antigen (D15)  25.23 
 
 		 769 aa  185  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.743361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6501  surface antigen (D15)  22.91 
 
 		 808 aa  174  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3196  surface antigen (D15)  23.7 
 
 		 811 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1917  outer membrane protein  32.52 
 
 		 809 aa  125  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.220726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0735  surface antigen (D15)  31.71 
 
 		 767 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000801153  hitchhiker  0.00000000000164396 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1648  hypothetical protein  24.27 
 
 		 780 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0470  surface antigen (D15)  23.37 
 
 		 730 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0533  surface antigen (D15)  24.48 
 
 		 743 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.885553  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0537  surface antigen (D15)  36.61 
 
 		 722 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1648  hypothetical protein  23.06 
 
 		 725 aa  107  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0492  surface antigen (D15)  21.53 
 
 		 761 aa  106  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0652  surface antigen (D15)  25.6 
 
 		 734 aa  104  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.496085  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2095  putative lipoprotein  29.74 
 
 		 775 aa  103  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.544397 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0176  hypothetical protein  33.63 
 
 		 741 aa  85.9  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2555  surface antigen (D15)  26.39 
 
 		 803 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  30 
 
 		 673 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  29.45 
 
 		 610 aa  60.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  29.38 
 
 		 961 aa  60.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  26.99 
 
 		 787 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  29.86 
 
 		 752 aa  59.7  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  26.99 
 
 		 787 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.72 
 
 		 765 aa  58.9  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.22 
 
 		 799 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  27.38 
 
 		 765 aa  58.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.97 
 
 		 790 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  26.83 
 
 		 786 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.38 
 
 		 750 aa  57  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.79 
 
 		 765 aa  55.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.02 
 
 		 784 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  28.03 
 
 		 763 aa  54.7  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 577 aa  54.7  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  33.33 
 
 		 577 aa  54.7  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 577 aa  54.7  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 577 aa  54.7  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  33.33 
 
 		 577 aa  54.7  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  33.33 
 
 		 577 aa  54.7  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.73 
 
 		 787 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  33.33 
 
 		 577 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  33.33 
 
 		 577 aa  54.7  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  33.33 
 
 		 577 aa  54.7  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  24.86 
 
 		 786 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  24.86 
 
 		 786 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.83 
 
 		 758 aa  54.3  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  24.73 
 
 		 791 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.56 
 
 		 784 aa  53.5  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0335  surface antigen variable number repeat protein  34 
 
 		 428 aa  53.5  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  30 
 
 		 781 aa  52.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  23.15 
 
 		 677 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.42 
 
 		 765 aa  52  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  27.37 
 
 		 765 aa  52  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  27.42 
 
 		 765 aa  52  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  27.83 
 
 		 796 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  26.28 
 
 		 791 aa  51.6  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  28.74 
 
 		 790 aa  50.8  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  25.17 
 
 		 806 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.76 
 
 		 848 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  33.71 
 
 		 780 aa  50.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  27.57 
 
 		 702 aa  50.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  33.09 
 
 		 577 aa  50.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  33.09 
 
 		 577 aa  50.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  33.09 
 
 		 577 aa  50.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  33.09 
 
 		 577 aa  50.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  22.66 
 
 		 677 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0512  outer membrane protein, putative  28.39 
 
 		 792 aa  50.1  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  29.38 
 
 		 765 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  24.32 
 
 		 795 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  22.66 
 
 		 657 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  29.49 
 
 		 766 aa  50.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  25.36 
 
 		 820 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  32.35 
 
 		 577 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  28.29 
 
 		 622 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  27.94 
 
 		 751 aa  49.3  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1136  surface antigen (D15)  32.85 
 
 		 564 aa  49.7  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.325603  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.5 
 
 		 793 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.5 
 
 		 793 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  30.17 
 
 		 573 aa  49.3  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  26.32 
 
 		 770 aa  48.9  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  25.61 
 
 		 792 aa  48.5  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  28.83 
 
 		 553 aa  48.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.2 
 
 		 784 aa  48.1  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  28.06 
 
 		 779 aa  47.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  25.23 
 
 		 765 aa  47  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03229  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.34 
 
 		 804 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.51 
 
 		 772 aa  47.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  30.09 
 
 		 821 aa  47.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1045 aa  47  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 1126 aa  47  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.86 
 
 		 803 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002754  outer membrane protein assembly factor YaeT precursor  26.62 
 
 		 804 aa  46.2  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>