More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1770 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1770  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
359 aa  725    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.952507 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1494  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.61 
 
 
348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2685  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.43 
 
 
343 aa  258  1e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.96 
 
 
463 aa  253  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.94 
 
 
514 aa  249  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2576  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.8 
 
 
422 aa  249  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.57 
 
 
583 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.79 
 
 
541 aa  244  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0299  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.33 
 
 
364 aa  245  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265949  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  37.18 
 
 
398 aa  243  3e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  37.94 
 
 
570 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.26 
 
 
530 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  37.5 
 
 
656 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.46 
 
 
584 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.47 
 
 
565 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.81 
 
 
473 aa  240  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.22 
 
 
383 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000182992  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  37.39 
 
 
530 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.47 
 
 
560 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  37.47 
 
 
540 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  38.55 
 
 
561 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1252  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.09 
 
 
479 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.225431  normal  0.30978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1998  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.48 
 
 
444 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  36.26 
 
 
485 aa  239  8e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.38 
 
 
506 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0522  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.33 
 
 
562 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2796  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.86 
 
 
423 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1022  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.98 
 
 
435 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0284952 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.64 
 
 
455 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0501  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.99 
 
 
451 aa  238  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3682  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.24 
 
 
601 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.82 
 
 
522 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.98 
 
 
405 aa  237  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.88 
 
 
525 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.88 
 
 
526 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.88 
 
 
515 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.88 
 
 
525 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.41 
 
 
491 aa  236  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.82 
 
 
462 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.55 
 
 
562 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.25 
 
 
456 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.9 
 
 
443 aa  236  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0320  hypothetical protein  36.52 
 
 
414 aa  235  8e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.24 
 
 
578 aa  235  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.24 
 
 
577 aa  235  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.54 
 
 
453 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.52 
 
 
452 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  37.02 
 
 
622 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.57 
 
 
515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.57 
 
 
515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.55 
 
 
474 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  36.72 
 
 
581 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185856  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.54 
 
 
453 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.57 
 
 
426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.61 
 
 
533 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.54 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.54 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.54 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  36.21 
 
 
543 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.05 
 
 
515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.24 
 
 
415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  37.04 
 
 
601 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.59 
 
 
471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000222801  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  36.84 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.08 
 
 
454 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.77 
 
 
550 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.24 
 
 
539 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.64 
 
 
540 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.08 
 
 
454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2755  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.43 
 
 
472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0813357  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.75 
 
 
482 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0066  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.65 
 
 
414 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.21 
 
 
418 aa  232  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  34.93 
 
 
418 aa  232  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.21 
 
 
418 aa  232  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.08 
 
 
454 aa  232  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.08 
 
 
454 aa  232  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.71 
 
 
504 aa  233  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0681  ATP-dependent RNA helicase  36.29 
 
 
420 aa  232  6e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.365485  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0786  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  36.29 
 
 
411 aa  232  6e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456558  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  37.08 
 
 
454 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.08 
 
 
454 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.08 
 
 
454 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.08 
 
 
455 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  37.08 
 
 
454 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  35.75 
 
 
485 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.75 
 
 
485 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  35.75 
 
 
485 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  35.75 
 
 
485 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.33 
 
 
439 aa  232  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  35.75 
 
 
485 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1595  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.21 
 
 
428 aa  232  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000842121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.31 
 
 
479 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  34.9 
 
 
516 aa  232  9e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0042  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.44 
 
 
420 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.94 
 
 
571 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1051  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.69 
 
 
458 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0480198  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.31 
 
 
480 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.14 
 
 
532 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 
448 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>