More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0304 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
166 aa  350  5.9999999999999994e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.792307 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0647  NADH dehydrogenase subunit I  43.94 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.413211  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  47.15 
 
 
156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1632  NADH dehydrogenase subunit I  44.35 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.285912  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0516  NADH dehydrogenase subunit I  47.15 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.93 
 
 
132 aa  108  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  42.02 
 
 
169 aa  104  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  38.67 
 
 
156 aa  99.8  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.9 
 
 
167 aa  98.6  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.83 
 
 
132 aa  97.8  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2049  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.3 
 
 
132 aa  95.5  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0933914 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.74 
 
 
132 aa  95.5  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.178845  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  40.54 
 
 
615 aa  78.2  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.78 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.61 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.75 
 
 
203 aa  70.9  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  40.95 
 
 
615 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.59 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.07 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  35.45 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  35.45 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  35.45 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.04 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  36.61 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.71 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  35.45 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  35.96 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  35.45 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  31.78 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
252 aa  67.8  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  35.45 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  35.45 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.09 
 
 
185 aa  67.4  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  35.45 
 
 
182 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  35.45 
 
 
182 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  34.34 
 
 
136 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  34.71 
 
 
211 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.76 
 
 
300 aa  67  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.71 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  34.17 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  32.52 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  34.17 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  32.52 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  34.17 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  34.55 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  31.88 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  33.1 
 
 
612 aa  66.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  34.17 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  38.37 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  32.31 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  38.37 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  33.93 
 
 
616 aa  65.5  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.71 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.55 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  32.91 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  33.64 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.2 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  32.76 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.13 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1210  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.11 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00161694  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.01 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  29.55 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  31.21 
 
 
187 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  35.92 
 
 
135 aa  63.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  31.82 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.77 
 
 
229 aa  63.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.92 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  32.91 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3251  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.71 
 
 
153 aa  62.4  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  35.83 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  32.91 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0374  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  35.83 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.74 
 
 
129 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.88 
 
 
168 aa  62  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2993  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.56 
 
 
440 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  30.89 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
175 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  29.09 
 
 
196 aa  61.6  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  33.64 
 
 
171 aa  61.2  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.23 
 
 
170 aa  61.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  34.17 
 
 
180 aa  60.8  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.63 
 
 
171 aa  60.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>