More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2049 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_2049  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
132 aa  276  7e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0933914 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  79.55 
 
 
132 aa  228  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.48 
 
 
132 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  71.97 
 
 
132 aa  208  2e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.178845  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1632  NADH dehydrogenase subunit I  45.61 
 
 
159 aa  96.7  9e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.285912  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.3 
 
 
166 aa  95.5  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.792307 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0516  NADH dehydrogenase subunit I  49 
 
 
155 aa  93.6  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  44.35 
 
 
615 aa  92  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0647  NADH dehydrogenase subunit I  47.57 
 
 
154 aa  92  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.413211  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  42.2 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.37 
 
 
132 aa  84.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.02 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.02 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.91 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  40.16 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.47 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.65 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  38.74 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  38.94 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.47 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.05 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  34.85 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  38.78 
 
 
169 aa  77  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
165 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  42.61 
 
 
615 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  33.83 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  33.83 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  39.81 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  38.6 
 
 
616 aa  75.5  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  30.71 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  36.59 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.3 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  34.31 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  34.09 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  36.17 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  36.22 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  34.92 
 
 
273 aa  73.6  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.45 
 
 
284 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218939  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.35 
 
 
179 aa  73.6  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2828  NADH dehydrogenase subunit I  37.1 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2557  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.840778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  34.07 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  35.82 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  38.1 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  37.25 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  36.61 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  34.07 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2576  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.7 
 
 
264 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  36.28 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.08 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  38 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0716  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36 
 
 
162 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479335  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  35.58 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  35.58 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.63 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  33.82 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1272  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.7 
 
 
270 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2697  NADH dehydrogenase subunit I  36.29 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  39.39 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.7 
 
 
267 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.340666  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  37.96 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  33.82 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  39.25 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  33.6 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  33.82 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  37.04 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  33.82 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  33.82 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  37.04 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  37.04 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  38.32 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  37.04 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  37.04 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  34.38 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  35.09 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  34.92 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  34.38 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  37.04 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.17 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  33.82 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  37.04 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  37.96 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  33.33 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  37.96 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  31.71 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  37.96 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  32.74 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.63 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  37.96 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  33.59 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>