More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1799 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  100 
 
 
257 aa  529  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  65.75 
 
 
257 aa  352  4e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  59.45 
 
 
255 aa  324  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  56.75 
 
 
268 aa  315  6e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  59.77 
 
 
263 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  57.94 
 
 
269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  57.54 
 
 
256 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  43.58 
 
 
256 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  45.06 
 
 
257 aa  221  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  44.53 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  44.53 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  44.53 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  44.53 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  44.14 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  44.53 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  44.14 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  44.14 
 
 
255 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  44.27 
 
 
255 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  44.92 
 
 
256 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  43.75 
 
 
255 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  44.84 
 
 
462 aa  215  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  43.36 
 
 
255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  42.02 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  43.41 
 
 
264 aa  211  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  43.08 
 
 
258 aa  211  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  42.52 
 
 
256 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  43.25 
 
 
464 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  42.75 
 
 
255 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  44.09 
 
 
257 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  42.86 
 
 
458 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  40.86 
 
 
263 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  42.46 
 
 
458 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  41.73 
 
 
457 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  39.29 
 
 
255 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  42.46 
 
 
271 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  43.25 
 
 
606 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  43.75 
 
 
251 aa  203  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  41.18 
 
 
257 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  38.82 
 
 
256 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  43.87 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  42.11 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  42.91 
 
 
461 aa  197  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  39.84 
 
 
462 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  40.55 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  39.53 
 
 
256 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  39.84 
 
 
255 aa  192  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  39.84 
 
 
256 aa  191  7e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  39.84 
 
 
255 aa  191  7e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  40.64 
 
 
256 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  39.23 
 
 
264 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  38.74 
 
 
256 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  41.5 
 
 
261 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  42.24 
 
 
261 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  39.37 
 
 
254 aa  185  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  35.69 
 
 
255 aa  184  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  41.02 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  39.61 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  40.62 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  38.67 
 
 
253 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  37.21 
 
 
459 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  39.16 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  37.26 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  40.46 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  36.72 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  39.31 
 
 
263 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  37.89 
 
 
256 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  39.08 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  38.61 
 
 
265 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  38.37 
 
 
257 aa  179  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  38.17 
 
 
267 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  36.08 
 
 
255 aa  178  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  38.7 
 
 
259 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  39.3 
 
 
273 aa  178  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  38.7 
 
 
259 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  38.7 
 
 
259 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  36.64 
 
 
267 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  38.72 
 
 
269 aa  178  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  41.18 
 
 
262 aa  177  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  39.92 
 
 
258 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  38.61 
 
 
264 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  41.04 
 
 
259 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  35.55 
 
 
255 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  38.31 
 
 
259 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  37.02 
 
 
267 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  38.31 
 
 
259 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  38.22 
 
 
257 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  39.06 
 
 
255 aa  175  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  39.31 
 
 
262 aa  174  8e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  37.11 
 
 
255 aa  175  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  35.83 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  38.13 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  38.93 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  38.19 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  38.55 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  39.61 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  36.05 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  36.36 
 
 
253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  39.53 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>