More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1438 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1438  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 332 aa  659    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1557  NADH dehydrogenase subunit H  75.9 
 
 		 332 aa  531  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000661956  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1743  NADH dehydrogenase subunit H  75.3 
 
 		 332 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.693854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1923  NADH dehydrogenase subunit H  75.3 
 
 		 332 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148771  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0188  NADH dehydrogenase subunit H  59.21 
 
 		 331 aa  425  1e-118  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1522  NADH dehydrogenase subunit H  61.63 
 
 		 330 aa  408  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000672667  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1663  NADH dehydrogenase subunit H  60.84 
 
 		 331 aa  409  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.418562  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0145  NADH dehydrogenase (quinone)  59.26 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000869539  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1821  NADH dehydrogenase subunit H  56.13 
 
 		 328 aa  322  4e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000044114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  43.63 
 
 		 341 aa  255  9e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.63 
 
 		 349 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  42.3 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  44.65 
 
 		 329 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  44.69 
 
 		 349 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.28 
 
 		 329 aa  248  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.81 
 
 		 337 aa  242  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  44.88 
 
 		 322 aa  243  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  41.19 
 
 		 348 aa  242  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 		 349 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  39.05 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  43.89 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  43.95 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  43.95 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  44.52 
 
 		 333 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.75 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  44.19 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  44.19 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  44.19 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  44.19 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  44.19 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  44.19 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  44.19 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  40.96 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  44.19 
 
 		 333 aa  232  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  44.19 
 
 		 333 aa  232  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  41.39 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  40.06 
 
 		 415 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  39.18 
 
 		 364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  37.87 
 
 		 345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1693  NADH dehydrogenase subunit H  41.64 
 
 		 348 aa  225  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.65 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.88 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  43.08 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  38.66 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  38.66 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  39.34 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  37.31 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  37.35 
 
 		 345 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.39 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0590  NADH dehydrogenase subunit H  41.97 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.148656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0579  NADH dehydrogenase subunit H  41.97 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.302811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  43.17 
 
 		 319 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  38.56 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  41.96 
 
 		 317 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  38.46 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.78 
 
 		 354 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  37.96 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  37.96 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  37.96 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  37.35 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  38.24 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  37.96 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  37.96 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  37.96 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  37.96 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  37.96 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  38.24 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  39.76 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  40.31 
 
 		 447 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  39.39 
 
 		 447 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  37.54 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  37.54 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  37.54 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  40.53 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  37.54 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  37.54 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  36.95 
 
 		 384 aa  212  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4125  NADH dehydrogenase subunit H  36.39 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1740  NADH dehydrogenase subunit H  36.39 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0467697  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2563  NADH dehydrogenase subunit H  37.2 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4065  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.29 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0444558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  36.92 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29930  NADH dehydrogenase subunit H  36.9 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  39.1 
 
 		 486 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0881  NADH dehydrogenase (quinone)  38.61 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000223152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.58 
 
 		 348 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  38.24 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  37.05 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3697  NADH dehydrogenase subunit H  36.09 
 
 		 335 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1867  NADH dehydrogenase subunit H  36.09 
 
 		 335 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0487349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1114  NADH dehydrogenase subunit H  41.4 
 
 		 323 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  37.58 
 
 		 341 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  37.39 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  39.06 
 
 		 447 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.66 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  37.79 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  38.01 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  36.98 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  37.39 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>