More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0188 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0188  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 331 aa  663    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1522  NADH dehydrogenase subunit H  69.79 
 
 		 330 aa  464  1e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000672667  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1663  NADH dehydrogenase subunit H  64.65 
 
 		 331 aa  449  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.418562  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1438  NADH dehydrogenase subunit H  59.21 
 
 		 332 aa  425  1e-118  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1557  NADH dehydrogenase subunit H  58.31 
 
 		 332 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000661956  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1743  NADH dehydrogenase subunit H  58.31 
 
 		 332 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.693854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1923  NADH dehydrogenase subunit H  58.01 
 
 		 332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148771  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0145  NADH dehydrogenase (quinone)  55.96 
 
 		 330 aa  383  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000869539  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1821  NADH dehydrogenase subunit H  58.47 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000044114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.41 
 
 		 329 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  44.34 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  41.49 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.13 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  43.83 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  41.09 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  41.21 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  40.79 
 
 		 349 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  44.13 
 
 		 330 aa  255  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  42.38 
 
 		 329 aa  255  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.17 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  40.52 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  44.13 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  43.28 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  42.95 
 
 		 333 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.22 
 
 		 337 aa  248  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  42.62 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  42.62 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  42.62 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  42.62 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  42.3 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  42.62 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  42.62 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  42.3 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  42.3 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.75 
 
 		 331 aa  245  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  40.24 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  42.62 
 
 		 333 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  41.31 
 
 		 333 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  39.94 
 
 		 340 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  44.74 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  39.62 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  38.58 
 
 		 345 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  40.31 
 
 		 349 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  42.52 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.07 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  38.51 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  38.99 
 
 		 342 aa  229  6e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  39.52 
 
 		 325 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  39.52 
 
 		 325 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  39.52 
 
 		 325 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  39.52 
 
 		 325 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  39.51 
 
 		 325 aa  228  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  39.52 
 
 		 325 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.87 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.71 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  36.61 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  39.74 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  39.74 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  43 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  39.51 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  39.51 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  39.51 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  39.51 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  40.06 
 
 		 415 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  40.19 
 
 		 486 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  39.51 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  39.51 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  39.51 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  39.51 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  37.31 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  38.94 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  40.06 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  39.53 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.47 
 
 		 389 aa  223  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  38.76 
 
 		 451 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.73 
 
 		 349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1498  NADH dehydrogenase subunit H  38.89 
 
 		 324 aa  222  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  41.16 
 
 		 420 aa  222  8e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  38.77 
 
 		 341 aa  221  9e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  38.77 
 
 		 341 aa  221  9e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  41.81 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  37.16 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  36.8 
 
 		 345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2563  NADH dehydrogenase subunit H  37.2 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  38.32 
 
 		 368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2418  NADH dehydrogenase subunit H  37.72 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.68011  normal  0.208608 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  37.75 
 
 		 372 aa  219  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40 
 
 		 354 aa  219  6e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  41.55 
 
 		 343 aa  219  7e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29930  NADH dehydrogenase subunit H  36.89 
 
 		 331 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  41.53 
 
 		 354 aa  218  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  41.37 
 
 		 447 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  37.65 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  37.38 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  37.96 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4065  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.31 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0444558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  37.65 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  38.04 
 
 		 384 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  39.94 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>